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如何寻找启动子——NCBI版

2023-03-05 16:29 作者:捡垃圾的心安  | 我要投稿

目标网址:National Center for Biotechnology Information (nih.gov)

美国国家生物技术信息中心(NCBI)

选择Gene数据库,输入目标基因名,以人类FAU基因为例

基因搜索结果

选择目的基因,点击进入详情页面

Human FAU基因详情

点击Genomic regions,transcripts and products栏右侧的FASTA选项

基因序列

通常,我们认为基因上游2kb区域大致未基因的启动子(promoter)

同时在详情页我们可以发现该基因为负链(reverse strand)

因此,human FAU基因的启动子大致在基因序列的右侧2kb区域

在右上角Changeregion shown调整显示的剪辑序列,把显示的起始数和终止数都增加2K

点击Update View


Update View

此时显示的就是基因的启动子序列。

SHOUer,生信入门

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