这篇如此简洁的生信分析凭什么发7分+？！就因为与它联系起来了？ 连铁死亡都甘当绿叶

嫌分析方法太过简单？

嫌分析思路太过老套？

想要创新升级的快点看过来吧！

话不多说，开门见山，小云今天给大家分享的热点就是它—氧化应激！

从国自然立项情况来看，自2012年以来，每年的中标个数及总金额都是非常可观，居高不下。

你见没见过哪个热点可以持续热这么久的？说明氧化应激在科学研究领域中的地位不言而喻。

那么按照惯例，小云肯定要找一篇氧化应激相关的生信文章给大家分享。（没有思路、不知道怎么创新的找小云，超多个性化、创新性高的分析思路供你选择！

小云今天就带你看看一篇亮点多多的氧化应激相关生信文章，难怪发到7分+了。

亮点包括：

1. 分析了氧化应激和免疫相关的基因，筛选出的关键基因可以作为疾病的诊断标志物。

2. 与铁死亡关联起来；

3. 利用单细胞数据分析关键基因的细胞定位。

发表时间：2022年8月

发表杂志：Oxidative medicine and cellular longevity

影响因子：IF=7.31

文章题目：动脉粥样硬化中氧化应激和巨噬细胞铁死亡相关的新型诊断生物标志物

数据信息

研究思路

基于GEO数据集分析差异表达基因（DEGs），与389个氧化应激(OS)相关基因取交集，获得与氧化应激相关的差异表达基因（DEOSGs）。利用WGCNA获得与免疫相关的关键模块基因，与DEOSGs取交集得到27个差异表达的免疫相关氧化应激基因(DEIOSGs)。构建PPI网络，筛选到6个hub基因作为AS的诊断标志物。

针对这6个hub基因进行常规分析（表达水平、功能富集、调控网络等）。分别将差异表达基因(DEGs)和WGCNA关键模块基因与铁死亡基因集取交集，得到了2个hub基因。单细胞分析显示，2个hub基因主要与巨噬细胞相关。最后进行了简单的实验验证。

主要研究结果

1、基于GEO数据集分析差异表达基因（DEGs），与389个氧化应激(OS)相关基因取交集，获得与氧化应激相关的差异表达基因（DEOSGs），并进行GO和KEGG分析。

2、利用WGCNA获得与免疫相关的关键模块基因，与DEOSGs取交集得到27个差异表达的免疫相关氧化应激基因(DEIOSGs)。

3、构建PPI网络，筛选到6个hub基因作为AS的诊断标志物。针对这6个hub基因进行常规分析（表达水平、功能富集、调控网络等）。

4、分别将差异表达基因(DEGs)与铁死亡基因、坏死性凋亡基因和细胞焦亡基因取交集，再将WGCNA关键模块基因与铁死亡基因，得到了2个hub基因。单细胞分析显示，2个hub基因主要与巨噬细胞相关。最后进行了简单的实验验证。

总结

这篇文章有几个亮点：

1. 分析了氧化应激和免疫相关的基因，进行了一系列的常规分析，证明5个关键基因可以作为AS的诊断标志物。

2. 分别与铁死亡基因、坏死性凋亡基因和细胞焦亡基因取交集，筛选到了与铁死亡相关的关键基因，与铁死亡关联起来；

3. 利用单细胞数据分析关键基因的细胞定位，为后续课题做基础。后面可以设计“ALOX5和NCF2通过调控巨噬细胞铁死亡参与AS坏死核心的形成”等相关课题。

氧化应激、免疫、铁死亡等多个热点结合肯定比单一热点要增色不少，还证明了关键基因的诊断价值，增加临床意义。此外，利用单细胞数据分析关键基因主要是影响哪一种细胞类型，后续的研究思路不就有了嘛！

如果你还苦恼于非肿瘤疾病没有思路，或者嫌分析方法太过简单、太过老套，想要创新思路的，或者对氧化应激/铁死亡等热点方向感兴趣的小伙伴快来联系小云吧！