质量评估Fastqc, multiqc

一般公司提交的是初步质控处理过的clean data，最好把raw data一并要过来。一般公司会对数据进行基本的质控，但我们还要再确认一次，为什么呢？个人遇到的情况包括以下几种：

• 部分样本的接头可能去得不完全

• 此外，为了数据量好看（更大），一般质量过得去的情况下，公司不会对reads前后端测序质量较低的碱基进行剪切，需要自己根据情况进行处理

• 有的公司对不同样本处理不一致，每个样本的clean data中reads长度可能