免费、开源密度泛函程序之Siesta
不少同学希望做DFT计算,但所在课题组又缺乏商业软件版权,因此时常让我推荐免费的DFT程序。这里我介绍一款:
Siesta,免费、开源、强大的DFT代码!
在众多DFT软件中,Siesta颇有特色,推荐理由有三:1 免费好用;2 速度快,即便是普通台式机、工作站,也可以计算多达500-1000个电子的体系; 3 开源,因此有不少子模块和扩展功能(例如扩展基组),特别有吸引力的是它可以计算输运性能,例如导电性能。
作为一个开源的量子模拟软件,具有媲美于商业软件VASP的所有功能,包括结构优化,能带结构,磁共线和非共线模拟,极化计算,分子动力学,态密度等等。由于采用原子轨道组合方法,Siesta具有极高的执行效率,能轻松处理上千个原子的体系。所以,如果你需要频繁处理较大体系,例如电子数1000以上,软件优势非常明显。
坦白讲,十多年前我学习Siesta的原因就是当时不得不处理一个多达800个原子的TiO2表面模型(计算老司机催化零基础课程提到过这个案例:柔性高分子链在TiO2表面的吸附与分解)。

另外一个不得不提到的模块就是TRANSIESTA。
它可以轻松实现分子,纳米团簇,一维/二维纳米材料的电导,IV曲线模拟。换句话说,它能计算输运性能,其计算基础是非平衡格林函数。作为Siesta的开源子模块,采用了完全相同的输入设置和文件格式,所以学会Siesta基本操作后就可以转入这一子模块的学习。值得一提的是,目前大部分DFT程序还不具备独立计算输运的能力,正因为这个缘故,TRANSIESTA在输运研究中广受青睐。更何况:它还免费。

开源免费软件的缺点也很明显:学习难度高!原因很简单:开源,就必然会有不同研究者进行改进,进而导致不断迭代更新。当然,如果你已经有一定密度泛函基础,Siesta的学习使用就是输入输出稍微熟悉练习一下即可,否则还是需要有人带着练习,尤其是采用TRANSIESTA计算输运性能。
老司机团队邀请到长期从事凝聚态物理的寇老师给我们进行讲解,包括一天的Siesta零基础小课,可以实现DFT水平做结构、能量、分子动力学、电子结构等典型计算,理论+操作+案例分析。在此基础上,会进一步开设TRANSIESTA小班课,介绍电子输运和非平衡格林函数方法。寇老师长期从事凝聚态物理研究,对Siesta和输运性质有深厚功底! 两个小班课,循序渐进,帮助初学者快速理解软件的输入文件、参数设置和模型构建,并通过实例解释具体模拟过程,输出文件分析和有效结果整理/可视化。
2023年1月29号、30号直播,会有录播可反复观看,需要请联系(加V:jisuanlaosiji)。
面向小白的Siesta零基础课程

Siesta进阶:TranSiesta计算输运性能
