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[BioLadder云平台] 轻松无忧绘制雷达图

2022-04-22 12:38 作者:青莲百奥  | 我要投稿

大家好!我是BioLadder生物信息在线可视化云平台的工程师小宇,今天我来给大家分享怎样用BioLadder画出雷达图

如果您反馈问题,报告Bug,提出新的需求,请直接在公众号内发留言给我哦!为感谢您对BioLadder的认可我们还有星爸爸同款收纳包相赠哦!小宇在这里先谢谢大家喽!

mini收纳包


1.什么是雷达图?

雷达图,它将多个维度的数据量映射到坐标轴上,每一个维度的数据都分别对应一个坐标轴,这些坐标轴以相同的间距沿着径向排列,并且刻度相同。 雷达图也称为网络图,蜘蛛图,星图,蜘蛛网图,不规则多边形,极坐标图。它相当于平行坐标图,轴径向排列。

雷达图和折线图是是很相似的,只不过坐标轴由直线坐标轴,变成了极坐标轴。

点击查看雷达图视频教程

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2.绘图前的数据准备

demo数据可以在

https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData/radarChart/demo.csv 下载。

包含2个维度的数据,必须包含行名和列名。每一行数据会在图上变成一条折线,列名对应坐标轴上的标签名称。

3. BioLadder生信云平台在线绘制雷达图

不想写代码?可以用BioLadder生信云平台在线绘制雷达图。

网址:https://www.bioladder.cn/web/#/chart/64

3.1 上传文件

点击“选择”按钮上传自己的文件,支持txt,csv,xlsx,xls四种格式

3.2 调整参数

根据需求调整参数即可

• 线条粗细:调整图中线条的粗细

• 点大小

• 标签字体大小:组名标签字体大小

• 轴字体大小:坐标轴百分比标签大小

• 是否自定义颜色:选中后在弹出的颜色板中选择合适的颜色,最大支持20个分组

• 标题名字

• 选择图例位置:可以选择图例的位置,设置图例名称及文字大小

3.3 提交查看

上传完数据,并调好参数后,点击右上方“提交”按钮,图像会出现在左侧。如果没有上传自己的数据,会使用默认的demo数据绘图。

3.4 下载

首先,挑选自己想要的格式有png,jpg,svg和pdf供选择,接着调整图片的宽,高和分辨率(注:这里的宽高比会反馈到左上的绘图区),最后点击“Download”下载按钮。

4.雷达图结果解读

将原始数据缩放到同一个比例,如图,内圈是0%,中圈是50%,外圈是100%

雷达图和折线图是是很相似的,只不过坐标轴由直线坐标轴,变成了极坐标轴。

5.BioLadder生物信息在线分析可视化云平台

网址:https://www.bioladder.cn/

BioLadder目前上线了生物学分析最常用的50多个模块,主要包括以下四类:

数据可视化:箱线图,南丁格尔玫瑰图,韦恩图,UpSet图,饼图,词云图,小提琴图,饼图/甜甜圈图,弦图,柱形图等

组学数据分析:序列的多重比对,表达数据的CV曲线图,饼图/甜甜圈图,T-SNE,热图,趋势分析的mFuzz,差异分析的火山图,富集分析的气泡图,修饰位点上下游模体分析的seqLogo,Motif热图等

功能分析:GO弦图,相互作用网络图,富集分析

数据预处理:归一化,补值,FDR校正,长宽表互换等

好了雷达图的绘制就到这里了,后续大家想要了解什么内容可以给我们评论反馈,我们会根据大家的意见持续更新。我们欢迎您以任何方式提出您的优化意见,使BioLadder平台成为广大科研工作者的生物信息分析首选平台!


[BioLadder云平台] 轻松无忧绘制雷达图的评论 (共 条)

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