spm-处理fmri静息态数据的步骤和batch处理的方法
本次处理的数据的结构是:before+after;
before和after下面各有3组,group1、2、3.
每个group下面有多个subject,每个subject下有结构像、静息态fmri、任务态fmri;
先处理静息态fmri, 步骤是slice timing、realign、coregister、segment、normalised、smooth.
单独的步骤百度下都有,例如https://blog.csdn.net/kakaviuviu/article/details/129322259
这里直接通过batch角度讲述,就会包含各个步骤的参数设计和含义。






第5步 normalised write-功能像标准化到MNI空间

第5步 normalised write-结构像标准化到MNI空间


设置完batch步骤后,点击file-save batch and script,保存生成2个mat程序
其中一个为变量输入程序名字为自己保存时候的名字,另外一个为执行程序带 job 后缀,从变量输入程度中读取参数执行任务,实际中不需要动job程序,只需要执行batch程序。
将MATLAB_CODE_TO_FILL_INPUT替换为实际的影像学数据所在路径,例如cellstr('F:\XXXXX');或者用变量替换,下面是实际运行的一个代码。