关于狗起源的论文梳理
基于现代家犬DNA研究得出的结论
1.支持东亚起源：
Genetic Evidence for an East Asian Origin of Domestic Dogs
发布时间：2002年
论文地址：https://www.researchgate.net/publication/11022078_Genetic_Evidence_for_an_East_Asian_Origin_of_Domestic_Dogs
mtDNA Data Indicate a Single Origin for Dogs South of Yangtze River, Less Than 16,300 Years Ago, from Numerous Wolves
发布时间：2009年
论文地址：https://www.researchgate.net/publication/26783108_mtDNA_Data_Indicate_a_Single_Origin_for_Dogs_South_of_Yangtze_River_Less_Than_16300_Years_Ago_from_Numerous_Wolves
Phylogenetic Distinctiveness of Middle Eastern and Southeast Asian Village Dog Y Chromosomes Illuminates Dog Origins
发布时间：2011年
论文地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3237445/
Origins of domestic dog in Southern East Asia is supported by Analysis of Y-chromosome DNA
发布时间：2011年
论文地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3237445/
Out of southern East Asia: the natural history of domestic dogs across the world
发布时间：2016年
论文地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4816135/
观点：根据东亚犬较高的遗传多样性，犬起源于东亚南部，随后一部分祖先犬15,000 年前向中东非洲和欧洲迁移，10,000 年前然后达到欧洲。然后，这些血统之一迁移回中国北部，并与亚洲流行的血统混合，然后再迁移到美洲。
后续：有人质疑东亚的起源，因为在欧洲发现了约15 000 年前的狗化石，而在俄罗斯远东地区只有12,000 年前的狗化石。作者答复：东亚的考古学研究落后于欧洲的考古学研究，而且东亚南部的环境条件不利于化石的保存。尽管过去这种狗的原始形式可能在欧洲存在，但遗传证据表明，后来这些狗被从东亚南部迁徙的狗所替代。但在2017年， 文献评论 发现，这项东亚研究仅对东亚乡村犬进行取样，并将它们的遗传多样性模式与其他地理区域的品种犬进行了比较。众所周知， 基因瓶颈与品种形成有关的基因会极大地降低遗传多样性，这种比较是不恰当的。（https://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev-animal-022114-110937）
2.支持中东和欧洲起源：
Genome-wide SNP and haplotype Analyses reveal a rich history underlying dog domestication
发布时间：2010年
论文地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3494089/
Evolutionary genomics of dog domestication
发布时间：2012年
论文地址：https://link.springer.com/article/10.1007/s00335-011-9386-7
观点：SNP多态性 表明狗起源于中东，是因为狗和中东灰狼之间共享的单倍型更多，这表明中东狼而不是东亚狼是家犬的起源。要么就是某些地方品种和地方狼之间可能存在大量混杂。2011年的一项研究发现，曾经发生过狗狼之间的杂交而不是之前的认为的发生过不同地区独立驯化事件，2012年的一项研究发现， 核基因组 来自源自中东和欧洲的狼
3.支持中亚起源：
Genetic structure in village dogs reveals a Central Asian domestication origin
发布时间：2015年
论文地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4640804/
观点：研究 常染色体，母亲 线粒体DNA （mDNA）和父系 Y染色体 （yDNA）来自38个国家/地区的纯种狗和乡村狗的多样性。在一些狗的数量 新热带 和 南太平洋 几乎完全来自欧洲的狗，其他地区则清楚地显示出本地狗和欧洲狗之间的混杂。越南，印度和埃及的乡村犬种群几乎没有欧洲混杂物，并且多样性低。 连锁不平衡 符合 中亚起源，然后东亚人口膨胀。该研究不能排除狗被驯养在其他地方并随后进入中亚并从中亚迁徙的可能性。对现存狗的研究不能排除较早驯化事件的可能性，这些事件随后逐渐消失或被更多现代人群所淹没。
后续： 2016年，这一发现受到全基因组研究的质疑，该研究包括来自东亚土著狗的连锁不平衡数据，发现这些基因的水平低于中亚狗的水平，表明是东亚血统。（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4868457/）由于由于基因组序列中使用的低覆盖率而导致的负面偏见，因此使该评估受到质疑。（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4868464/） 2017年，一篇文献综述发现，由于已知与品种形成相关的遗传瓶颈会导致连锁不平衡，因此将纯种犬与乡村犬进行比较是不合适的。（https://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev-animal-022114-110937）
基于古DNA研究
中亚
Ancient DNA Analysis Affirms the Canid from Altai as a Primitive Dog
发布时间：2013年
论文地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3590291/
观点：2013年，一项研究研究了保存完好的33,000年之久的头骨， 下颌骨 从拉兹博尼奇亚洞（Razboinichya Cave）挖出的狗状犬科动物 阿尔泰山脉 西伯利亚南部（中亚）。 mDNA分析发现，它与狗的关系比与狼的关系更紧密。 2013年下半年，另一项研究发现，由于犬只介于狗和狼之间，因此无法对其进行分类。（https://www.science.org/doi/10.1126/science.1243650） 2017年，进化生物学家审查了所有关于狗的证据，并支持来自阿尔泰山的标本是来自现已灭绝血统的狗的样本，这些血统是从现已灭绝的小型狼群衍生而来的。
欧洲
Complete Mitochondrial Genomes of Ancient Canids Suggest a European Origin of Domestic Dogs
发布时间：2013年
论文地址：https://www.science.org/doi/10.1126/science.1243650
Multiple and Ancient Origins of the Domestic Dog
发布时间：1997年
论文地址：https://www.science.org/doi/10.1126/science.276.5319.1687
Relaxation of selective constraint on dog mitochondrial DNA following domestication
发布时间：2006年
论文地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1524871/
Old wild wolves: ancient DNA survey unveils population dynamics in Late Pleistocene and Holocene Italian remains
发布时间：2019年
论文地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6441319/
The first evidence for Late Pleistocene dogs in Italy
发布时间：2020年
论文地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7414845/
北极东北西伯利亚
Ancient DNA Analysis of the Oldest Canid Species from the Siberian Arctic and Genetic Contribution to the Domestic Dog
发布时间：2015年
论文地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4446326/
