热点思路梳理-细胞焦亡

大家好呀!今天跟大家从已发表的焦亡文章,梳理下如何细胞焦亡如何发文章。
细胞焦亡(pyroptosis)是由炎性小体引发的一种细胞程序性死亡,表现为细胞不断胀大直至细胞膜破裂,导致细胞内容物释放进而引起强烈的炎症反应。细胞焦亡的发生依赖于炎性半胱天冬酶(caspase)和GSDMs蛋白家族,越来越多的证据证实了细胞焦亡在肿瘤中的重要作用,关于细胞焦亡与肿瘤关系的结论并不完全一致,这表明肿瘤的异质性和免疫微环境的复杂性。细胞焦亡不仅可以抑制肿瘤细胞增殖,还可以形成适合肿瘤细胞生长的微环境,促进肿瘤生长。
第一篇 Cell Death Discovery(IF:5.241)
细胞焦亡分子亚型识别+预后模型构建+功能富集
第一篇文章(A novel defined pyroptosis-related gene signature for predicting the prognosis of ovarian cancer[J]. Cell Death Discovery)作者在卵巢癌中对细胞焦亡基因进行刻画,分析了表达水平的差异,基于细胞焦亡基因的识别分子亚型,构建与验证预后模型,识别差异基因与功能分析,刻画免疫活性。



第二篇 Cell Death Discovery(IF:5.241)
细胞焦亡预后模型构建+TME+ceRNA网络
关于这篇肺腺癌的文章(Identification of the pyroptosis related prognostic gene signature and the associated regulation axis in lung adenocarcinoma)作者对细胞焦亡基因的表达水平、遗传改变和功能进行刻画,基于细胞焦亡基因构建预后模型,分析了TME、TMB、MSI和药物敏感性,最后基于重要临床特征构建了ceRNA网络。


第三篇Frontiers in Cell and Developmental Biology(IF6.684)
细胞焦亡分子亚型识别+TME+免疫治疗
第三篇细胞焦亡文章(The Pyroptosis-Related Signature Predicts Prognosis and Indicates Immune Microenvironment Infiltration in Gastric Cancer,Front. Cell Dev. Biol.)作者收集了医院临床样本,并且训练数据量很大,内容也非常丰富,刻画得很细致。在胃癌中,作者分析了细胞焦亡基因的表达水平和遗传改变,并且基于临床样本进行验证,识别了分子亚型并对亚型进行TME和临床特征的分析,构建风险模型并进行验证和TME与免疫治疗的刻画。
第四篇 OncoImmunology(IF:8)
细胞焦亡分子分型+TME+突变landscape+免疫治疗
关于这篇结直肠癌的文章(Identification of pyroptosis-related subtypes, the development of a prognosis model, and characterization of tumor microenvironment infiltration in colorectal cancer),发的比较高,8+的杂志,作者对细胞焦亡基因的表达水平、遗传改变和功能进行刻画,然后分子分型,基于细胞焦亡基因构建预后模型,分析了TME、TMB、MSI和药物敏感性。

感兴趣的小伙伴们可以仔细研读细细体会下,纯生信思路,蹭热点就趁现在。
