三维空间转录组

目前，采用SEURAT等计算机算法、激光显微切割加二代测序、基于空间条形码以及高分辨图像原位测序等手段，在传统的基因时空转录调控基础上，获得基因表达组织空间位置信息。这对于研究发育问题、肿瘤组织细胞来源具有重要的价值。使研究者能够了解组织中细胞构成多样性和基因表达状态，对于揭示细胞之间相互作用有重要的应用价值。目前，已经应用到病理学、脑神经学、肿瘤、免疫以及发育生物学领域。

既往方法，或者说传统方法，组织匀浆获得单细胞悬液，不可避免地丢失了细胞在组织中的位置效应和基因表达空间通讯网络，三维空间转录组学或三维基因组学解决了这一难题。