一学就会！利用StringTie拼接转录本和定量（一）
尔云间 一个专门做科研的团队
欢迎点赞+收藏+关注
生信人R语言学习必备
立刻拥有一个Rstudio账号
开启升级模式吧
（56线程，256G内存，个人存储1T）
小果之前带大家进行了转录组参考序列的比对，结果也是很顺利地跑出来了，接下来该做什么呢？当然可以进行基因表达水平分析啦。
进行基因表达水平分析可以帮助我们了解不同组织或条件下的基因表达情况，从而揭示生物体在不同生理或环境条件下的分子响应机制。
比如，在肿瘤研究中，我们可以通过分析肿瘤组织和正常组织的基因表达水平，找到肿瘤特异性基因并深入研究其调控机制，以期找到更好的肿瘤治疗方法；在植物研究中，我们可以通过分析在逆境条件下的基因表达情况，探索植物的应激响应机制并发现植物抗逆基因，以期提高作物的耐受性。因此，基因表达水平分析是分子生物学研究的重要手段之一。
重要性已经了解了，下面我们开始吧，在开始之前确保你已经拥有参考序列比对的结果哦：
我们需要用到samtools，如果没有的话，需要先安装：
使用的时候记得激活一下环境。
我们先了解一下获得的sam数据，使用代码查看文件：
接下来等待结果即可！
格式转化成功后就可以进行下一步分析了！
小果今天就分享到这里，下期不见不散！
欢迎使用：云生信 - 学生物信息学 (biocloudservice.com)
想用服务器私信小果哦
“生信果”，生信入门、R语言、生信图解读与绘制、软件操作、代码复现、生信硬核知识技能、服务器、生物信息学的教程，以及基于R的分析和可视化等原创内容，一起见证小白和大佬的成长。
