地下水数值模拟中，连续的研究区将为由节点和有限差分网格或有限个单元组成的离散域所代替。选择什么样的模型，将决网格的维数。

1 网格类型

如前所述，有限差分法有两种网格：节点法和格点法。两者的差别只在第二类边界条件的处理上。modflow就是采用的格点法。

2 模拟目的层

概念模型可以帮助我们是识别模拟的目的层是一个，还是几个。显然，一个含水岩组的情况只需要一个目的层。在有多个含水岩组的情况下，模拟目的层的选定就和模拟的目的、要求、地质、水文地质条件有关了。模拟目的层确定以后，模型的类型也就选定了。