更实用!批量解析 Sanger 测序.ab1文件~出图出文本
写在前面
年前,推了两个插件,主要针对基因克隆实验中常见需求,即引物设计以及Sanger测序结果解读....(主要还是为了情怀,都是我接触生信之前一直想要的功能...),对应了三个推文:
《实用 | PCR 引物特异性?用Primer Check检测一下》
《眼见为实!Sanger测序峰图比对到参考序列 - 直观!》
《有点意思!Sanger 测序峰值图自动解析单倍型》
其中最后一个推文事实上,是在「TBtools」老铁使用过之后做了增强。转眼两周过去了。万万没想到,不少湿实验的朋友过年期间一直在加班干实验。今天下午,收到南农和老师的反馈信息,主要建议增加一个批量模式,主要原因是,往往基因编辑的结果材料有几十上百株系,而不仅仅是三五个...原本相关工作需要数天,有了插件可能还需要三四天,但如果支持批量模式,那么....
完全在理。收到这个反馈信息的时候,我突然觉得「TBtools」工作确实没做到位。开发「TBtools」的出发点在于减少湿实验科研人员在数据分析上的时间投入,让大伙更多陪伴家人。
稍微迟疑了一会,采纳了和老师的建议,并做了简单调整,于是得到新版插件,暂时略去交互分析,重在批量处理。
Batch Sanger Sequencing Result Check
新插件的界面如下:

相关使用简单,直接给个示例

运行结束后,可以在设置的输出目录中看到输出文件,大体如下

感觉不错~
写在最后
Emmm.... 正如前述,
一个好用的工具,常常用户很多;
而用户很多的工具,常常才会是好用的工具。
PS: 「生信药丸」上不时会恰饭,后台留言有不少意见....大伙可以有意见,但饭就是要恰,没得商量。
差点忘了....
插件的安装与使用
《TBtools Cookbook》 - 写给「TBtools」所有用户的参考手册 https://www.yuque.com/cjchen/hirv8i
你想知道的,都在里面了:
软件/数据库的下载/更新
对应功能的使用说明与具体示例
常见问题 FAQ 及解决方案
如何有效提出 TBtools 使用问题从而快速获得回复并得到解决
插件的获取
差点,忘了....
推文在看,随后分享推文到朋友圈,集齐 6 个点赞,
截图发送到「香蕉平行线」公众号
回复 Batch Sanger Check,即可获得下载链接,具体如下

PS II: Emmm... 最近与专门做学术论文编辑/润色的机构 TopEdit (https://topeditsci.com/)有合作,对方提供了TBtools用户专属优惠码(85折),即 TBTOOLS85 ,全网最高折扣码,可以重复使用(如推荐给其他需要的朋友);若发现更高折扣,可以与我提,再争取更高优惠力度....
本文使用 文章同步助手 同步