[番外3]机械拼图——生命树下的病毒

病毒 Virus,仅仅由DNA或RNA和蛋白质[包膜从宿主细胞获得]所组成的小小分子,在过去几年里,造成了巨大的损失[1]。
从某种角度来看,人类史就是一部病毒史。

从中世纪的黑死病[忘了,好像不 Virus],到欧洲殖民者带入美洲大陆的天花。
病毒史贯穿人类发展的始终。
病毒 Virus最早是在 1892年由俄国生物学家伊凡诺夫斯基在研究烟草花叶病时发现,将感染了花叶病的烟草叶的提取液过滤后,依然能够感染其他烟草,要知道此方法可以将细菌给过滤下来。[2]

但对于真正的发现者来言:机会往往会在嘴边飞走,就像是煮熟的鸭子一样。像是[呃,忘记了]
伊凡诺夫斯基将其定为了一些细菌分泌物[2]。直到电子显微镜等技术出现后,病毒的研究才迎来热潮。
值得关注的是,随着全球气温的不断上升,更新世的冻土层不断熔化,科学家也已从中解冻出多种病毒,从2020至2023都有,甚至也有线虫这样的。这在宣示人类也要反思,保护自然了。

我们都知道,生物都是由细胞所组成的,除了病毒。那么,在系统树上,几乎没有见到病毒的影子,似乎他们就是一支演化的幽灵,在一棵不断的生命树上游荡,没有位置,没有过往,没有根,甚至没有生命[有争议,但个人以为应该是有的。]。

没有人知道他们的演化,分类(特指目级以上)。最早的高级分类体系是诺贝尔奖获主美国生物学家巴尔的摩在1971[5]年提出并由后面学者完善的,这套体系被称为巴尔的摩分类体系。
根据DNA,RNA的种类和单双链,mRNA的正(可以直接做模板)负(不可以直接做模板,先RNA互补一次)义分类。依次是:
- 双链DNA病毒dsDNA
- 单链DNA病毒ssDNA
- 双链RNA病毒dsRNA
- 正单链RNA病毒+ssRNA
- 反义单链RNA病毒-ssRNA
- 单链RNA反转录病毒RT-RNA
- 双链DNA反转录病毒RT一DNA
[注:不规范的写法]
在这种分类种系,我们可以清晰地查阅每种病毒的种类。并且可以知道:
①在细菌和古细菌中,绝大多数病毒都是dsDNA ,大部分在10~100 kb 范围内。第二个最常见的类别包括小型ssDNA 病毒。正链RNA 和 dsRNA 病毒极为罕见,并且没有已知的逆转录病毒。

②与细菌和古细菌不同,真核生物拥有大量高度多样化的 RNA 病毒(尤其是正链RNA病毒)以及逆转录病毒。
[这似乎藏着一个惊天动地的秘密。——《三体》。]

国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)[2]建立的完整且权威的分类体系[2017年,国际通用],做出了从域~种的15个官方等级,新加了门~域级别的等级。但比较难看出病毒的遗传属性。


虽然,国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)和巴尔的摩分类体系可能都是并系群,都没有(也没办法)反映真实的演化,但结合两者,我们有希望——一探究竟。[下期见]

物种名单:病毒 Virus,
特点:仅仅由DNA或RNA和蛋白质[包膜从宿主细胞获得]所组成的小小分子
分类:见文章。国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)和巴尔的摩分类体系。
起源和演化:见[番外四]及[五]

来源:
[1]人民日报等
[2]wiki
[3](其实去b站搜一下——解冻病毒就好了)
[4]
The new scope of virus taxonomy: partitioning
the virosphere into 15 hierarchical ranks
[5]
Baltimore, D., 1971. Expression of animal virus genomes. Bacteriol. Rev. 35 (3),
235–241.
[6]Ancient origins of viruses discovered
[7]bio.libretexts.org
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QAQ,写了半天,这么短。www