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R可视化——ggplot2包绘制火山图

2022-08-12 09:14 作者:科研那点事儿  | 我要投稿

火山图(Volcano plot是一种将统计测试中的统计显著性量度(如p value)和变化幅度相结合,从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点(基因等)的散点图,因图形与火山喷发相似而得名。

加载数据

数据主要由三行构成——基因名称列、Log2FoldChange(差异倍数)、pvalue(p值)。

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基本火山图绘制

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设置阈值并用不同颜色显示

1、设置阈值

2、绘图

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3、添加辅助线

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4、主题设置

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添加标签

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完整代码及数据可在微信公众号【科研后花园】后台回复“火山图”获取!

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