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病毒(细胞)RNA的提取

2023-02-21 17:35 作者:大家好我是常明谦  | 我要投稿

一、实验材料

微量移液器(1mL、200μL)DEPC水处理过的枪头/EP管Trizol试剂氯仿异丙醇75%乙醇(用DEPC水配制)

二、实验原理

在哺乳动物中,平均每个细胞内大约含有10-15μg RNA,其中rRNA占总量的80%-85%,tRNA和核内小分子RNA占10-15%,而mRNA只占1-5%。Trizol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。Trizol的主要成分是异硫氰酸胍和酚。异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放。酚虽可有效的变性蛋白质,但是它不能完全抑制RNA酶活性,因此Trizol中还加入了β-羟基喹啉、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase。在加入氯仿离心后,溶液分为水相和有机相,RNA选择性地进入无DNA和蛋白质的水相中。取出水相用异丙醇沉淀可回收RNA;用乙醇沉淀中间层可回收DNA;用异丙醇沉淀有机相可回收蛋白质。

三、实验方法

1. 直接在培养板中加入Trizol裂解细胞,24孔板每孔加1 ml,用移液器吸打几次

2. 1ml Trizol加入0.2ml氯仿,剧烈振荡15s,冰浴10 min。(注意:此步振荡非常重要,建议在旋涡振荡器上进行,使其充分混匀。)

3. 4℃ 12000 rpm离心5 min。样品分为三层:底层为蓝色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用Trizol试剂的60%

4. 把400-600 μl水相转移到新的EP管中,加入等体积的异丙醇,混匀,室温放置10 min。(异丙醇作用为沉淀RNA)。该步骤中的10 min可以缩短为5 min(贴壁细胞可以换成5 min,原代细胞10 min)。

5. 4℃ 12000 rpm离心10 min,弃上清。(离心前看不出RNA沉淀,离心后在管侧和管底出现胶状沉淀)(注意:该步骤很关键,一定要弃干净。弃掉一次之后再甩一下用将管壁的残留离心下来,用白枪头吸尽残存的液体)

6. 加入1mL 75%乙醇洗涤RNA沉淀。4℃ 7600 rpm离心5 min,用枪头吸尽残存的乙醇。(该步骤用100%乙醇洗涤和75%乙醇洗涤差别不大,配置75%乙醇比较浪费DEPC水

7. 打开离心管管盖,室温放置干燥,使残存的痕量乙醇挥发殆尽,直至白色沉淀看不见为止即可

8. 加20~50μl DEPC水溶解。

四、注意事项


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