蛋白肽段鉴定

蛋白肽段鉴定就是对蛋白质酶解得到的小分子肽段进行鉴定，主要包括定性定量鉴定、分子质量鉴定、氨基酸序列鉴定以及翻译后情况如修饰类型、修饰位点以及修饰水平鉴定。蛋白肽段鉴定是进行蛋白质鉴定的重要内容，基于质谱技术的蛋白质鉴定通常都是通过“自下而下”的策略实现的，即通过直接分析小分子肽段来实现完整蛋白的分析。

质谱技术可以实现多种蛋白肽段鉴定，是蛋白肽段鉴定的重要手段。通常结合液相色谱技术即利用液相色谱串联质谱对蛋白肽段进行鉴定，大致流程为先将肽段通过液相色谱进行分离，再对分离后的肽段进行质谱检测，采集肽段母离子的碎片信息，最后根据质谱数据如肽段离子质荷比、离子峰强度等信息与理论的蛋白数据库进行比较，再结合相应生物信息学分析手段实现肽段的鉴定。