组织RNA提取(Trizol法)、浓度测定及反转录
一、RNA提取(Trizol法)
1. 取30mg组织放入匀浆管(内置磁珠)中,加入1ml Trizol,用匀浆器进行3次组织匀浆,每次15s。最后检查管内是否还有大的组织块,若有则继续匀浆,直至无肉眼可见的组织块。
2. 最大转速瞬离匀浆管。将溶液吸入到新的EP管中,室温放置5min。
3. 加入0.2ml 氯仿,剧烈混匀,溶液呈现乳状,室温静置5min,4℃ 12000g离心15min。
4. 吸取上层水相于新的EP管中(注意不要吸到中间层,一般1ml Trizol可以吸到400-500ul液体)。加入1.5倍体积的异丙醇(600ul),上下颠倒混匀,室温静置10min,4℃ 12000g离心10min。
5. 弃上清,注意不要弃去RNA白色沉淀,加入1ml 75%乙醇(用DEPC水配)洗涤,上下翻转使RNA沉淀浮起,4℃ 7500g离心5min。
6. 弃上清,注意不要弃去RNA白色沉淀,加入1ml 75%乙醇(用DEPC水配)洗涤,上下翻转使RNA沉淀浮起,EP管按相反方向放入离心机,4℃ 7500g离心5min。
7. 弃上清,注意不要弃去RNA白色沉淀,4℃ 7500g离心1min,200ul枪头吸去残留液体。
8. 室温晾干5-10min。
9. 加入30ul DEPC水溶解RNA。
10. NanoDrop测浓度,放置于-80℃冰箱保存或直接进行反转录。
二、RNA浓度测度及反转录
(试剂盒PrimeScript RT Master Mix ,TAKARA,RR036A)
1. Nanodrop测RNA浓度,用于进行反转录。
2. 体系配制:1000ng RNA,4ul 5× RT Master mix,RNase free water补足到20ul
3. 混匀后放入PCR仪反应,条件如下:37℃, 30min → 85℃, 1min → 4℃, ∞
4.ddH2O将反转录后的cDNA稀释到2.5 ng/ul,-80℃保存。