时空日报 | Nature：Netrin-1阻断抑制子宫内膜癌的肿瘤生长和EMT特征

大家好，欢迎观看《时空日报》第28期。本期追踪到时空/单细胞组学相关研究文章共计7篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。

1、Netrin-1阻断抑制子宫内膜癌的肿瘤生长和EMT特征

Netrin-1 blockade inhibits tumour growth and EMT features in endometrial cancer

Nature; IF: 64.800; DOI: 10.1038/s41586-023-06367-z

内容概要：该研究探讨了Netrin-1在子宫内膜癌（endometrial carcinomas，ECs）中的表达情况，并证明了使用抗Netrin-1抗体（NP137）可以有效减少EC小鼠模型中的肿瘤进展。结合bulk RNA-seq、空间转录组、scRNA-seq等分析，证明了Netrin-1阻断是一种临床策略，可以触发肿瘤缩小和EMT抑制，从而可能缓解对标准治疗的耐药性。

2、scRNA-seq鉴定体内前胸腺素α对HIV-1的限制作用

Single-cell transcriptomics identifies prothymosin α restriction of HIV-1 in vivo

Science Translational Medicine; IF: 17.100; DOI: 10.1126/scitranslmed.adg0873

内容概要：使用scRNA-seq方法，通过将宿主基因表达与单个细胞内病毒RNA含量相关联，鉴定了限制HIV-1病毒的宿主因子。研究发现，编码前胸腺素α的基因PTMA与病毒RNA转录呈负相关，且过表达前胸腺素α可抑制HIV-1转录和感染病毒的产生。这一发现对于病毒传播和治疗策略具有重要意义。

3、单细胞分析揭示FOLR2表达的肿瘤相关巨噬细胞向调节性T细胞的转化在肺腺癌进展中的轨迹

Single-cell profiling reveals the trajectory of FOLR2-expressing tumor-associated macrophages to regulatory T cells in the progression of lung adenocarcinoma

Cell Death and Disease; IF: 9.000; DOI: 10.1038/s41419-023-06021-6

内容概要：从不同病理分期的肺腺癌（lung adenocarcinoma，LUAD）患者中采集LUAD样本和正常肺样本，通过scRNA-seq对细胞组分进行分类和转录组分析，并进行生物信息学研究，生成了从LUAD前侵袭期到侵袭期的单细胞转录组图谱，并揭示了ARM-RETN/TAM-FOLR2/DCs/CD4+NR4A3/CD4+FOXP3轨迹在LUAD发病过程中塑造免疫抑制微环境的潜在机制。

4、鸡的scRNA测序揭示神经板边界细胞命运分配的概率模型

scRNA-sequencing in chick suggests a probabilistic model for cell fate allocation at the neural plate border

eLife; IF: 8.713; DOI: 10.7554/eLife.82717

内容概要：通过对鸡胚胎原始条纹到神经化阶段的scRNA-seq分析，探索了细胞状态的多样性和异质性，建立了神经板边界细胞命运选择的概率模型。该研究发现，神经板边界应被视为异质性的外胚层领土，而不是离散的转录状态。神经板边界细胞共同表达竞争性转录程序，其最终身份尚未确定。细胞命运选择的概率与竞争性转录程序的平衡有关，而这些程序受到祖细胞的时空位置调节。

5、肿瘤浸润γδT细胞揭示了在结直肠癌中具有显著异质性的耗竭亚群

Tumor-infiltrating gamma delta T-cells reveal exhausted subsets with remarkable heterogeneity in colorectal cancer

International Journal of Cancer；IF: 6.400; DOI: 10.1002/ijc.34669

内容概要：该研究探究了结直肠癌（colorectal cancer，CRC）肿瘤浸润γδT细胞的表达模式和功能状态，揭示了这些细胞的耗竭亚型特征。该研究发现，TI-γδT细胞在CRC TME中表现出疲耗竭表型和更严重的功能耗竭，且存在三种耗竭亚型，包括Tex1、Tex2和Tex3。此外，还发现c-Maf不仅通过上调抑制性受体促进γδT细胞耗竭，还参与了CD8T和NK细胞的耗竭。

6、Trps1在小鼠Leydig细胞中作为Sf-1转录和睾酮合成的调节因子

Trps1 acts as a regulator of Sf-1 transcription and testosterone synthesis in mouse Leydig cells

Cell Biology and Toxicology; IF: 6.100; DOI: 10.1007/s10565-023-09823-8

内容概要：通过scRNA-seq等分析，发现Trps1在Leydig细胞中表达丰富。实验表明，Trps1缺失可促进睾酮合成并增加Sf-1转录因子和睾酮合成酶的表达水平，还可降低组蛋白去乙酰化酶1/2的活性并增加Sf-1启动子上的组蛋白H3乙酰化水平，从而促进睾酮分泌。此外，Sf-1也通过激活转录因子2来调节Trps1的转录。这些结果表明，Trps1通过组蛋白去乙酰化和Sf-1的靶向作用来影响类固醇激素合成，并揭示了Trps1在小鼠Leydig细胞中的重要作用。

7、scRNA-seq分析定义的儿童T细胞急性淋巴细胞白血病母细胞特征和MRD相关免疫环境变化

Pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia blast signature and MRD associated immune environment changes defined by single cell transcriptomics analysis

Scientific Reports; IF: 4.996; DOI: 10.1038/s41598-023-39152-z

内容概要：通过scRNA-seq分析11名儿童T细胞急性淋巴细胞白血病（T-cell acute lymphoblastic leukemia，T-ALL）患者的骨髓样本，发现T-ALL细胞与免疫微环境之间的信号交互异常是T-ALL发展的重要因素。T-ALL细胞的基因表达谱呈现出明显的异质性，其中SOX4、STMN1、JUN、HES4、CDK6、ARMH1等基因的过表达与T-ALL患儿的不良预后相关。诱导治疗后，MRD+EOI样本中残留的T-ALL细胞表达PD-1和RhoGDI信号通路的上调显著，骨髓中T细胞和造血干细胞之间的细胞通讯也存在差异。

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