热点方向还不内卷，且看内质网应激在生信分析中的无限潜力，还没有选好研究方向的抓紧

2022-08-31 10:05 作者:尔云间 0人读过 | 我要投稿

你是否还没有选好研究方向？

你知道有哪些热点方向还不内卷的？

内质网应激会给你带来惊喜！

国自然这个月下旬就要放榜啦，到时候又是几家欢喜几家愁。中标的就可以轻松一下啦，没中的也别灰心，花点时间好好准备，而且还有小云每天给你分享好的研究思路，总有一款适合你！

小云认为选好研究方向就成功了一大半，那今天就来说一说“内质网应激”这个热点方向。内质网应激一直以来都是顶级期刊、基金资助、药物研发靶点、临床研究的热点，与多种疾病有关，还与肿瘤微环境、自噬、蛋白质稳态等相关。因此，内质网应激是一个不错的课题方向，很值得研究，可以作为课题的一个起点。

问题是：如何开始做内质网应激呢？最简单的方法就是从生信分析开始，初步分析不同疾病中内质网应激相关基因的变化及其与疾病的相关性。然后通过细胞和动物实验深入探究调控内质网应激的分子机制，最后可以向临床转化，开发靶向调控内质网应激进而干预疾病的药物。

接下来小云带你看一篇分析内质网应激的生信文章

文章题目：内质网应激相关标记预测透明细胞肾细胞癌的预后和药物反应

发表杂志：Frontiers in pharmacology

影响因子：IF=5.988

发表时间：2022年7月

数据信息

研究思路

通过对295个内质网应激相关基因的共识聚类将TCGA中透明细胞肾细胞癌（ccRCC）样本分为C1和C2亚型。分析不同亚型患者的预后、免疫细胞浸润水平、与抑制性免疫检查点相关的基因表达水平以及药物反应。基于两组之间的差异表达基因(DEGs)构建了与内质网应激相关的预后风险模型，并验证该预测风险模型的准确性。最后分析Connectivity Map (CMap)数据库，筛选出潜在的治疗化合物。

主要研究结果

1.根据内质网应激相关基因的共识聚类鉴定两种ccRCC亚群

根据295个内质网应激相关基因的共识聚类，将TCGA数据集中的ccRCC样本形成了C1 (n = 360)和C2 (n = 166)两个亚群(图1A)。C2亚群患者的生存期OS比C1亚群患者的OS更短(图1J)。