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全球首发丨MobiCube 单细胞兔V(D)J试剂盒填补兔单细胞免疫组库研究空白

2023-06-14 10:53 作者:博奥晶典科研服务  | 我要投稿

北京博奥晶典生物技术有限公司(以下简称“博奥晶典”)与墨卓生物开展深度合作,引进了 MobiNova®-100 高通量单细胞建库系统,强势推出了国产化的单细胞转录组、单细胞免疫组库等技术服务,为单细胞领域的研究提供了更加全面、更加稳定和更高性价比的解决方案。墨卓生物在推出了 MobiCube® 高通量单细胞 V(D)J 试剂盒、3’ 转录组 V2.0 试剂盒之后,又首发上市了 MobiCube® 高通量单细胞兔 V(D)J 产品,这是全球范围内第一款兔 V(D)J 商业化试剂盒,可广泛用作临床诊断,疫苗研发,免疫学研究,药物研发等。

单克隆抗体在生物医药领域有广泛应用,其中源于兔的单克隆抗体因高亲和力、高特异性和识别更多抗原表位等优势,受到单克隆抗体筛选研究人员的关注。
单克隆抗体常见筛选方法为杂交瘤技术和噬菌体展示技术,但两项技术均存在筛选效率低筛选周期过长的不足,这也是限制抗体开发速度的因素之一。
如何缩短周期,提高抗体筛选效率是加速兔抗体开发的关键。高通量单细胞 V(D)J 全长测序可一次完成上万单细胞的 mRNA 捕获,单次实验即可获得数万 B 细胞的 V(D)J 全长序列,直接对接下游抗体序列合成,进而显著缩短抗体筛选周期及提高筛选效率。该技术也因此获得很多抗体筛选 CRO 公司的青睐。

产品介绍

MobiCube® 高通量单细胞 V(D)J 试剂盒(兔)基于微流控技术,可同时对每个细胞完成 mRNA 分子的捕获,并在此过程中给捕获的 mRNA 分子打上细胞特异性分子标签。完成 mRNA 分子捕获后,通过逆转录和 NGS 文库构建,即可获得单个细胞的转录组信息。

与此同时,以逆转录获得的 cDNA 为模板,可通过多重 PCR 或巢式 PCR 获得每个细胞内的全长 VDJ 序列信息。
产品应用

墨卓生物高通量单细胞 V(D)J(兔)测序平台,可结合流式细胞术/免疫磁珠分选等方法,先从兔 PBMC 或者脾脏等样本中分选得到 B 细胞,再用墨卓的高通量单细胞 V(D)J 测序平台,完成单 B 细胞的 VDJ 测序,一周内即可快速获得候选抗体序列。

当然作为高通量单细胞平台,客户也可以获得单细胞悬液后,直接进行高通量单细胞转录组文库构建及测序。因为通过转录组信息,墨卓可以帮客户高效鉴定样本中的 B 细胞,同时给出对应的 VDJ 序列信息。

数据表现

●模拟真实场景的数据表现

为了模拟流式细胞术/免疫磁珠分选后得到细胞数较少的真实场景,墨卓将投入细胞量调整至 8000 个,进行本次测试,对于客户关心的 B 细胞也重点进行了测试。

在此情况下,通过 5’ 端转录组测序识别到 4,002 个细胞,中值基因数在 1,375。

细胞注释图

在此样本中捕获 B 细胞 2,710 个,其中重轻链成功配对率达到 85.6%。这些细胞都可以拿到全长的 V(D)J 序列信息,构建抗体表达载体,用于生产抗体。


BCR映射图

●令人安心的稳定性

同样在投入低细胞的情况下进行稳定性测试。将一份 PBMC 样本一分为二,在两台 MobiNova®-100 仪器上进行测试。结果显示,两组实验的细胞分群图高度重叠,在投入 5000 个细胞的情况下,捕获细胞数为 2301,2501,中值基因数分别为 1006,1008。从细胞分群、捕获细胞数、中值基因数上均表现出高重复性。


2 次独立测试,兔 PBMC 样本 5 端转录组图谱高度重复

独立测试1                                           独立测试2


VDJ 数据分析结果也显示,两组测试的 BCR 富集效果高度可重复,同时, BCR 的重轻链配对率均达到 80% 以上。


关于博奥晶典

博奥晶典科研服务拥有一支高素质、经验丰富的专业技术团队,一直以顾客为中心,以坚持科技领先,服务完善,注重细节,质量稳定为基本点,提供创新、完善的整体解决方案。在20多年的科研服务过程中,一贯秉承高质量的专业技术服务精神,自主开发和引进了一系列先进的高通量筛选和验证平台,为国内外众多的科研院所提供科研服务,支持国内外科研机构及企事业单位发表 SCI 论文超过2500篇,杂志总影响因子超过13000分,文章领域涉及基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组、微生物组、系统生物学等多个技术领域。


关于墨卓

创新驱动、卓鉴未来,墨卓生物创立于美国波士顿,落地中国浙江,汇集了由国际一流科学家和跨国医疗器械公司高管等组成的一批优秀人才。墨卓致力于用创新微流控和单细胞测序技术赋能科学研究与精准医疗。目前已经成为拥有微流控、测序、生化、硬件开发、生信等关键技术,推出单细胞测序与数字PCR双技术平台,在液体活检、伴随诊断、生命科学研究等多领域并行发展的科研+IVD解决方案领跑者。



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