灰狼基因组史揭示了狗的双重血统论文归纳总结

https://www.nature.com/articles/s41586-022-04824-9

发表在nature上的这篇文章影响很大，很多报道都只是点到即止，论文中很多有意思的论点并没有多少人提及。现将论文中的观点进行梳理归纳：

1. 狗与欧亚大陆东部的古代狼比与欧亚大陆西部的古代狼的亲缘关系更为密切，这表明了在东方的驯化过程。

   We show that dogs are overall more closely related to ancient wolves from eastern Eurasia than to those from western Eurasia, suggesting a domestication process in the east.

   这个已经是很多论文都反复证明的观点了，现代家犬和亚洲东部的狼亲缘关系更近而与亚欧亚大陆西部的狼亲缘关系较远，因此不会出现欧洲狗混血部分欧洲狼从而和东方犬亲缘关系上变得更接近的情况。很多东方犬被归类为原始犬种，仅仅只是部分人基于其外形/功能的一种划分方式。不同地区的狼也是有遗传差异存在的。

2. 近东和非洲的狗有多达一半的祖先来自与现代欧亚大陆西南部狼有亲缘关系的独特种群，这反映了一个独立的驯化过程或和当地狼的混合。

   we also found that dogs in the Near East and Africa derive up to half of their ancestry from a distinct population related to modern southwest Eurasian wolves, reflecting either an independent domestication process or admixture from local wolves.

   这个也不是新观点了，2012年的一篇文章就提及到此事，https://link.springer.com/article/10.1007/s00335-011-9386-7  

3. 许多现代和古代的北美狼显示出郊狼（Canis latrans）混合的证据，狼和郊狼开始分化约70万年前，在我们的欧亚大陆狼中随着时间的推移，观察到有郊狼的祖先成分，欧亚狼之间的郊狼亲和性有轻微的西-东梯度，但这种模式可能反映了来自郊狼中来自北美狼（与西伯利亚东部的狼有关）的成分。

   We found a slight west–east gradient of increasing coyote affinity among Eurasian wolves, but this pattern probably reflects admixture into coyotes from North American wolves

   换句话说，欧亚大陆狼身上检测到的郊狼成分很有可能是郊狼混有北美狼成分（与西伯利亚东部的狼有关）的原因，而且这种成分有轻微的西-东梯度差异，而不是郊狼真的迁徙到了亚洲地区。

4. 所有现在的北美狼都可以被建模为具有10-20%的郊狼血统，其余的祖先来自年龄小于约23 ka的西伯利亚狼，而早期的北美狼没有贡献

   末次冰期前的早期北美狼被2.3万年前的西伯利亚狼取代了。目前的北美狼是西伯利亚狼和郊狼的混血。

5. 论文结论：（1）东方和西方祖先的独立驯化，后来在西方融合；（2）东方祖先的单一驯化，随后随着狗进入欧亚大陆西南部与西方狼混合。

   (1) independent domestication of the eastern and western progenitors that later merged in the west or (2) single domestication of the eastern progenitor, followed by admixture from western wolves as dogs arrived into southwestern Eurasia.

   得出的结论偏保守，文章中提到采样的最早的欧洲犬（1万年前的位于东北欧的karelia狗）其成分反而是100%东方祖先，现代的欧洲犬其欧亚大陆西部狼成分（西方祖先）主要接近中东狼而不是欧洲狼，似乎是随着新石器时期中东农业人群向欧洲扩散而带来的成分。这一成分按照论文的推测，约占今天欧洲犬的5%-25%，近东非洲南亚犬的20%-40%，文章作者很谨慎，没有拿到中国古代犬狼的古DNA数据，虽然有测部分现代东亚品种，但是文中没有涉及中国本土犬的变迁史，东亚地区是否像中东一样，混合有额外来源的本土狼成分，目前任然是未知数。虽然之前的对中国古犬的线粒体研究显示中国古人有饲养狼/混血狼犬的先例（陕西泉护村），但是这种古犬是否有遗传下来，和今天的东亚本土犬的关系究竟如何，需要更进一步的古DNA研究给出更准确的结论。