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CADD+ROSetta(线下)+分子动力学-amber+Namd入门合集

2023-06-25 17:01 作者:点点课  | 我要投稿

Rosetta 是一套用于模拟大分子结构的综合软件,具有灵活、多用途的应用。包括蛋白质和

核酸的结构预测、设计以及重塑。Rosetta 的 web 服务器已经运行了数十亿的结构预测和蛋白质

设计模拟,研究人员利用 Rosetta 可以更好地了解传染病、癌症和自身免疫性疾病的治疗方法,

进一步应用于包括开发疫苗、新材料、靶向蛋白粘合剂和酶设计等。

分子动力学模拟是分子模拟中最接近实验条件的模拟方法,能够从原子层面给出体系的微观

演变过程,直观的展示实验现象发生的机理与规律,促使学术研究向着更高效、更经济、更有预

见性的方向发展。可以解决和研究 DNA 的折叠和性质、蛋白与配体的识别机制、跨膜蛋白的工作

机理、蛋白酶与底物的反应、蛋白与蛋白的耦合、比较野生型与突变蛋白的不同特性等。

近年来,利用高性能计算机来进行药物虚拟筛选已经被广泛应用,计算机辅助药物设计可以

提高药物研发的成功率,降低研发成本,缩短研发周期,是目前创新药物研究的核心技术之一。

随着医药大数据的积累和人工智能技术的发展,运用 AI 技术并结合大数据的精准药物设计也不

断推动着创新药物的发展

7-8月安排的《 (线下北京)Rosetta +(线上)CADD-AMBER-NAMD四个》学习项目,诚邀您的参与。
项目一:计算机辅助药物设计--蛋白对蛋白-分子对接-虚拟筛选等内容(线上六天),
项目二:Rosetta抗体设计优化结构(线下三天),北京
项目三:Amber结合自由能设计计算应用--线上四天
项目四:NAMD生物材料计算应用(线上三天)

微信:1047608967

  1. 公众号:

(无限次回放视频+班级微信群+讲义资料+全部案例模型)

Rosetta 专题讲师:由国家双一流、985 高校特聘研究员、博士生导师讲授。近五年发表

SCI 研究论文 20 余篇,获国际生物设计会议奖励(The International BioDesign Research

Conference)。主持基金委蛋白质设计相关项目和科技部重点研发计划课题多项。主要擅长分

子设计、分子模拟方法研究。

NAMD 专题讲师:来自国家“双一流”建设高校,“211’工程。拥有近 10 年丰富的 NAMD

使用经验。以第一/通讯作者在《

ACS advanced materials & interface》等国际 top 期刊发

表论文数十篇。擅长领域:蛋白质分子动力学,蛋白质纳米材料相互作用机制,蛋白质测序等。

AMBER 专题讲师:山东省重点高校特聘教授、省优青团队人员,研究团队在国际知名期刊

发表 SCI 论文 50 余篇。其中以第一作者发表的两篇 JACS 属于本领域顶级 TOP 期刊(一区论文,

IF: 14.612)。主持国家自然科学基金及省部级课题多项。主要从事生物分子量化计算和分子

动力学模拟研究,在动力学模拟、量化计算、结合自由能计算等积累了丰富的经验。

CADD 专题讲师:由全国重点大学、国家“双一流”、“211 工程”重点建设医药类高校副

教授,硕士生导师讲授。发表 SCI 研究论文 20 余篇,主持和参与国家级、省部级自然科学基

金项目多项。拥有多年新药分子设计和开发经验,主要擅长 CADD、AIDD 等药物设计方法研究。




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