王镜岩-生物化学(第三版)配套练习及详解第九章 核酸的生物合成
第九章 核酸的生物合成
I 主要内容
一、DNA的半保留复制
复制时DNA的两条链分开,分别作模板合成新链形成两个DNA 新链。
1.复制子和复制方式
基因组中能够独立进行复制的单位称为复制子,每个复制子都含有复制起点和终点。复制方向大多数是定点双向,起点一个或多个,因此在复制的部位形成叉形,称为复制叉。滚筒式复制是单向复制的特殊方式。
2.参与复制的酶和蛋白质因子
(1)DNA聚合酶:①原核细胞:DNA聚合酶I、II和III,其中DNA聚合酶III真正具有合成新链的复制作用。②真核细胞:DNA聚合酶α、β、γ、δ,其中DNA聚合酶α真正具有合成新链的复制作用。
(2)DNA连接酶:催化双链DNA切口处5′- 磷酸基和3′-羟基生成磷酸二酯键的酶。 连接酶作用的过程中,在原核细胞中以NAD+提供能量,在真核细胞中以ATP提供能量。
(3)拓扑异构酶:拓扑异构酶I消除DNA的负超螺旋,改变DNA的超螺旋数;拓扑异构酶II引入负超螺旋,消除复制叉前进带来的扭曲张力。
(4)引物合成酶:催化RNA引物的合成,作用时该酶与另外6种蛋白结合形成引发体。
(5)DNA单链结合蛋白(SSB):与DNA分开的单链结合防止双链重新结合。
3.复制的方向:5′- 3′
4.复制的过程:双链解开;RNA引物的合成;DNA新生链的延长;切除RNA引物,填补缺口连接相邻的DNA片段;切除与修复错配碱基。
二、DNA的损伤与修复
紫外线、电离辐射和化学诱变剂等理化因素可以导致DNA产生损伤,严重者可以导致生物死亡。DNA损伤的修复方式主要有光复活、切除修复和重组修复和应急反应(SOS)。
三、逆转录酶
逆转录酶是依赖RNA的DNA聚合酶,催化以RNA为模板的DNA合成,是多功酶。
四、RNA的生物合成——转录
1.RNA聚合酶
原核细胞的RNA聚合酶的全酶由五个亚基(α2β2σ)组成,没有σ亚基的酶为核心酶。σ因子的功能是使RNA聚合酶与DNA结合,核心酶可以使已经开始的转录过程完成。真核细胞的RNA聚合酶,根据对α-鹅膏蕈碱的敏感性分为三类:RNA聚合酶A、B和C。A对α-鹅膏蕈碱不敏感,B对低浓度的敏感,C对高浓度的敏感。
2.录启动和终止的调节
启动子和启动因子:从转录起点向上的第十个核苷酸(-10)处有TATAAT保守序列,是RNA聚合酶识别和结合的部位;另一个保守序列TTGACA中心位于-35处,是RNA聚合酶的识别信号。
终止子和终止因子:终止子位于已转录的RNA序列中,它使RNA聚合酶在模板上的移动减慢RNA的合成停止,终止因子有依赖和不依赖ρ因子两种。
3.录的过程和调节。
4.转录后加工:tRNA、mRNA和rRNA的前体通过剪接、拼接和甲基化等方式进行加工。
II 习 题
一、解释名词
1.密码子:
2.逆转录:
3.中心法则:
4.基因重组:
5.不对称转录:
6.冈崎片段:
二、是非题: 判断下列每句话的意见正确与否,对的画“√”,错的画“×”,并说明理由。
1.所有核酸的复制过程中,新链的形成都必须遵循碱基配对的原则。
2.原核细胞的每一个染色体只有一个复制起点,而真核细胞的每一个染色体就有许多个复制起点。
3.细胞中,DNA链延长的速度随细胞的培养条件而改变。
4.所有核酸合成时,新链的延长方向都是从5′- 3′。
5.抑制RNA合成酶的抑制剂不影响DNA的合成。
6.在E.coli细胞和真核细胞中都是由DNA聚合酶I切除RNA引物。
7.缺失DNA聚合酶II的E.coli突变株,可以正常地进行染色体复制和DNA修复合成。
8.在真核细胞中,三种主要RNA的合成都是由一种RNA聚合酶催化。
9.大多数mRNA 5′-端都是由嘧啶核苷酸起始的。
10.真核细胞的mRNA两个末端都有3- OH基团。
11.无论是在原核或真核细胞中,大多数mRNA都是多顺反子的转录产物。
12.一段人工合成的多聚尿苷酸可自发形成双螺旋。
三、填空题
1. mRNA前体的加工一般要经过 、在5′-端 和在3′-端
三个步骤。
2.逆转录酶是催化以 为模板,合成 的一类酶,产物是 。
3.核糖体的 亚基上含有与mRNA结合的位点。
4.RNA聚合酶复合物中的因子具有 作用。
5.DNA双链中编码链的一段核苷酸顺序是pCpTpGpGpApC,转录的mRNA顺序应该是 。
6.每个冈崎片段是借助连在它 端的一小段 引物,每个冈崎片段的增长都是由 端向 端延伸。
7.DNA复制时,前导链的合成是 的,复制方向与复制叉移动方向 ,后随链的合成是 的,复制方向与复制叉移动的方向 。
8.在真核细胞的DNA切除修复过程中,受损伤的碱基可由 切除,并由
和 共同作用将缺失的碱基补上。
9.在实验室使用的大多数诱变剂都是属于 诱变,而大多数致癌物质都是属于 诱变。
10.在线粒体中的环状基因组是通过 合成方式复制。
四、选择题
1.下列何者是DNA复制的底物?
A ATP B dUTP C dTTP D dGDP
2.下列何者是DNA的基本单位?
A dAMP B dUTP C dTTP D dGDP
3.下列有关DNA聚合酶III的论述,哪一项是错误的?
A 是复制酶 B 有5′-3′聚合活性
C 有3′-5′外切酶活性 D 有5′-3′,外切酶活性
4.下列有关DNA聚合酶I的论述,哪一项是错误的?
A 是复制酶,又是修复酶 B 有3′-5′外切酶活性
C 有5′一3′聚合活性 D 没有5′-3′,外切酶活性
5.下列有关DNA复制的论述,哪一项是正确的?
A 领头链是不连续合成的 B 随从链是连续合成的
C 新链合成的方向与复制叉前进方向相同者,称领头链
D 新链合成的方向与复制叉前进方向相反者,称领头链
6.下列与DNA解链无关的是:
A 单链DNA结合蛋白 B DNA Helicase
C DNA旋转酶 D DNA酶
7.下列哪一项属于DNA自发损伤?
A DNA复制时碱基错配 B 紫外线照射DNA生成嘧啶二聚体
C x-射线间接引起DNA断裂 D.亚硝酸盐使胞嘧啶脱氨
8.下列哪一项引起DNA移码突变?
A DNA中的腺嘌呤转换为鸟嘌呤 B DNA中的胞嘧啶转换为尿嘧啶
C DNA中的鸟嘌呤颠换为胸腺嘧啶 D DNA链缺失一个核苷酸
9.下列有关反向转录的论述,哪一项是错误的?
A 以DNA为模板合成cDNA B 合成的双链DNA称为前病毒
C 逆转录酶既催化cDNA的合成又催化模板RNA水解
D 引物不是以病毒DNA为模板合成的
10.下列有关真核生物转录的论述,哪一项是正确的?
A 利福霉素及利福平可抑制其RNA聚合酶
B 利福平与σ亚基结合
C 不作为转录模板的DNA链称为编码链
D 启动子通常位于结构基因的下游
11.在E.co1i细胞中DNA聚合酶I的作用主要是:
A DNA复制 B DNA合成的起始
C 切除RNA引物 D 冈崎片段的连接
12.5—氟尿嘧啶是经常使用的诱变剂,它的作用是:
A 在DNA复制时,可引入额外的碱基。
B 取代胸腺嘧啶核苷酸到新合成的DNA分子中,在新链DNA复制时产生错配碱基
C 使腺嘌呤、鸟嘌呤和胞嘧啶脱氨。
D 参入RNA导致密码子错位。
13.小白鼠的基因组比E.co1i的基因组长600多倍,但是复制所需要的时间仅长10倍因为:
A 染色质蛋白加速小白鼠DNA的复制。
B 在细胞中小白鼠基因组不全部复制。
C 小白鼠DNA聚合酶合成新链的速度比E.co1i DNA聚合酶快60倍。
D 小白鼠基因组含有多个复制起点,E.co1i的基因组只含有一个复制起点。
14.细菌DNA复制过程中不需要:
A 一小段RNA作引物 B DNA片段作模板
C 脱氧三磷酸核苷酸 D 限制性内切酶的活性
15.利用逆转录酶进行复制的动物病毒带有:
A 单链线形RNA B 单链线形DNA
C 双链线形DNA D 双链共价封闭环形DNA ·
16.下列物质可以作为逆转录病毒进行逆转录引物的是:
A 特异性的寄主tRNA B 特异性的寄生蛋白
C U6snRNA D U2snRNA
17.参与DAN复制的酶和蛋白质因子包括:⑴DNA聚合酶III;⑵解链蛋白和解旋蛋白;⑶DNA聚合酶I;⑷RNA聚合酶;⑸DNA连接酶。它按如下顺序工作。
A ⑷、⑶、⑴、⑵、⑸; B ⑵、⑶、⑷、⑴、⑸;
C ⑷、⑵、⑴、⑸、⑶; D ⑷、⑵、⑴、⑶、⑸;
E ⑵、⑷、⑴、⑶、⑸。
18.DNA半保留复制时,如果一个完全放射标记的双链DNA分子在不含放射物的溶液中复制两轮,共产生四个DNA分子,其放射性为:
A 半数分子无放射性; B 所有分子都有放射性;
C 半数分子的两条链有放射性; D 一个分子的两条链都有放射性;
E 都无放射性。
19.大肠杆菌DNA连接酶的催化活性是:
A.在双螺旋DNA一条链断开处形成磷酸二酯键;
B.催化两条游离的单链DNA分子形成磷酸二酯链;
C.以DNA作能源; D 以ATP作能源。
20.配伍酶促反应:
A DNA聚合酶Ⅲ; B DNA聚合酶I; C 引发酶;
⑴引物RNA合成; ⑵DNA复制;
⑶切除引物RNA; ⑷损伤DNA的暗修复。
五、问答与计算
1.简述原核细胞内DNA聚合酶的种类和主要功能。
2.如何用实验证实在复制叉区域存在许多小片段(Okazaki片段)?
3.每次DNA合成的起始需要一小段RNA作引物,E.co1i RNA聚合酶受利福平的抑制。 (1)把利福平加到正在进行对数生长的E.co1i群体中,对DNA复制会产生什么影响? (2)如果将E.co1i在缺乏某种生长必需因子的培养基中饥饿两小时,然后再加入这种生长必需因子和利福平,对DNA复制会产生什么影响?
5.组织培养产生的哺乳动物细胞系的细胞中,每个DNA长1.2m,这些细胞生长周期中的S期长达5小时,如果这种细胞DNA延长的速度与E.co1i相同,即16μm/min,那么染色体复制时需要有多少复制叉同时运转?
6.如果E.co1i的DNA长度为1100μm,复制一代大约需要40分钟通过一个复制叉完成,求复制体的链增长速度和DNA螺旋的旋转速度是多少(以每分钟的转数表示)