文献晶体数据改进示例7(升空间群)

案例来源：Dyes Pigments 2022, 198, 109992.

DOI：10.1016/j.dyepig.2021.109992

CCDC：2123297

图形用户界面：Olex2[1]（版本：Olex2-1.5）

精修程序：SHELXL[2]（版本：SHELXL-2019/2）

CIF文件下载：CCDC[3]官网

根据CCDC号从CCDC官网下到2123297.cif文件，用Olex2打开并提取其hkl和res文件查看，如图1所示，CIF文件中缺失大量信息，这些信息其实很容易获得，但却都缺失了。

由于信息的缺失，并且晶胞参数和空间群无法对应，导致该数据存在大量AB级警报，如图2所示。

该数据Rint高达34.38%，再结合吸收校正信息的缺失，推测该数据可能没有做吸收校正，如果做吸收校正的话，Rint值可能会有所下降。（示例：https://www.bilibili.com/video/BV1K34y1U74u）

对该数据进行升空间群操作，填入一些适当信息如晶体尺寸等，截断分辨率，并进行适当精修，最终结果如图3所示。

此时重新处理后的数据checkCIF报告如图4所示。

视频操作演示请参阅：https://www.bilibili.com/video/BV11u411T7ig

结语

晶体测试时的一些信息应当及时记录，如晶体尺寸，测定晶胞的相关信息等，保存相关文件，对数据进行适当的吸收校正，结合checkCIF报告对相关问题进行有针对性的适当处理。

参考文献

[1] Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A complete structure solution, refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.

[2] (a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/2, Program for Crystal Structure Refinement, University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history of SHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M. Crystal structure refinement with SHELXL. Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d) Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.; Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.

[3] (a) Allen, F. H. The Cambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures and rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. (b) Allen, F. H. The Cambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures and rising. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179.