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VASP计算扩散能垒

2023-08-18 19:42 作者:大呀大香米  | 我要投稿

  图片未上传,需要带图版可加wx:lrm______或邮箱liruimin0187@link.tyut.edu.cn 

本教程为使用VASP 5.4.4软件计算扩散能垒教程,请提前安装VESTA(用于建模及转换格式)、materials studio(较大,若已安装VESTA可不安装,用于建模)。

以计算LiF中Ca离子扩散能垒为例,大致步骤为,下载LiF晶体结构 – 扩胞 – 优化 – 构建Ca离子在LiF中初末态构型 – 优化 – 生成中间态构型 – 优化 – 处理数据。

一、获得初末态离子迁移模型

l    同计算吸附能部分从materials project下载LiF (mp-1138) cif文件,扩胞2*2*2,生成VASP计算文件,结构优化后CONTCAR去MS添加Ca在LiF间隙位点,获得初末态离子迁移模型,左图为MS显示图,右图为VESTA图,VESTA图更便于观察配位情况。

二、生成中间态迁移路径模型

l    同计算吸附能部分生成VASP计算文件,更改INCAR中ISIF=2再优化结构,将计算初末态得到的CONTCAR更改为新的POSCAR,分别命名文件夹为start和end,用neb_path.py代码生成9个path的迁移路径

l  此时文件夹下出现11个迁移路径的VASP计算文件夹

l    生成的11个文件夹中,0和10为start和end的POSCAR,仅需计算1-9即可,使用start和end相同的INCAR、POTCAR和KPOINT,逐个计算。

三、生成迁移路径能垒图

l  将服务器计算得到的OUTCAR和CONTCAR保存到各自文件夹下,使用neb_barrier.py代码自动生成Ca迁移路径图,同使用neb_path.py的命令,先cd到当前文件夹路径下,再执行python neb_barrier.py命令,即可自动生成迁移路径能垒pdf文件

 

 

 


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