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初入生信

2023-02-22 19:03 作者:生信小尧  | 我要投稿

生物信息入门

一、什么是生物信息学?

    生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理、存储、传播,分析和解释等各方面的学科,也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展,生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学,计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。——来自于百度百科

(Bioinformatics)

就是利用信息科学来处理生物数据,以解决生物学问题

注意: Bio 在前,informatics 在后!

否则就是另一门学科

    然而随着现在测序技术的发展,测序成本越来越低,测序数据越来越多,就需要越来越多的计算机能力去处理这些数据,也需要越来越多的生物信息学人才。因此,学习一门生物信息分析流程还是很有必要的!

二、生信分析需要学习哪些东西?

  1. 分子生物学

  2. 计算机编程(R、Linux、python等)

  3. 生物统计学

  4. 相关生物分析软件

三、为何生物信息学难学呢?

Part.1

交叉学科

既要求你有生物学背景,又要有较强的计算机背景,还需统计学基础。多门学科的糅杂在一起,当然难啦。

Part.2

内容繁杂

生物信息分析包括很多内容,如:基因组、转录组、蛋白组、代谢组等方面,每类有许多分支,不同物种差别又大,很难一劳永逸,放之四海而皆准的分析方法流程。

Part.3

发展快速

基本没有固定的流程软件算法,再加上测序技术的不断发展,需要不停的学习。

四、生物信息学的应用

Part.1

在微生物方面的应用

微生物在宿主组织中生长所需要的物质合成、分解代谢以及调节相关基因都可以作为抗微生物药物设计的候选靶位。生物信息学为发现新的、更有效的药物靶位和保护性抗原提供了最大的可能。

Part.2

在农业上的应用

  1. 数据挖掘与利用

  2. 电子克隆

  3. 基因组分析

  4. 农业模式植物研究

  5. 种质资源保存研究

  6. 农药设计开发研究

  7. 作物遗传育种研究

Part.3

在食品安全研究领域中的应用

运用生物信息学方法获得各种致病菌的核酸序列,并对这些序列进行比对,筛选出用于检测的引物和探针,进而运用PCR法、对电阻抗、放射测量、ELISA法、生物传感器、基因芯片等技术进行快检。

Part.4

在医学方面的应用

1.基因组相关信息的收集、存储、管理与提供。

2.新基因的发现与鉴定。 

3.非编码区信息结构分析。

4.生物进化的研究。

5.完整基因组的比较研究。

6.基因组信息分析方法的研究。

7.大规模基因功能表达谱分析。

8.蛋白质末端序列、分子空间的预测、模拟和分子设计。

9.药物设计等

五、生物信息学未来发展趋势

    生物信息学将揭示人类及重要动植物种类的基因信息,为生物大分子结构模拟和药物设计提供巨大的帮助。生物信息学不仅对认识生物体和生物信息的起源、遗传、发育与进化的本质有重要意义,而且将为人类疾患的诊治开辟全新的途径,还可为动植物的物种改良提供坚实的理论基础。

    生物信息学的发展已经超越了它最初的目标,现在可以说生物信息学的重要目标在于理解生物学数据和揭示生命本质,但是它的前景仍然是不可估量的。可以肯定,在不远的将来,生物信息学的研究成果不仅被应用于生物、医学等相关领域,同时将对其它学科包括信息科学、数学、计算机科学、物理学等研究产生巨大的影响。

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