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自动化核酸质控常青树——安捷伦2100生物分析仪

2022-05-26 15:03 作者:分子科普小feng子  | 我要投稿

核酸质控在我们做生物实验时是一项可能会被忽视,但是其实很重要的工作。因为我们的核酸质量会直接影响到我们之后的实验成败,如果没有对核酸进行质量控制,我们甚至可能会在下游实验中得到错误的实验结果。

而我们传统的核酸质控往往采用凝胶电泳的方法。步骤繁琐,耗时耗力,实验效率较低。也容易产生人为误差,影响质控分析结果。而且对于多次结果之间也无法直接比较,更多的依靠我们对于条带的主观判断。

那么我们有没有灵敏度更高实验效率更好实验步骤更简单的核酸质控方式呢?

答案是 当然有!

2100生物分析仪于1999年上市,是安捷伦自动化电泳产品中的常青树,也是目前在安捷伦样本质控产品中唯一一台可以检测DNA,RNA和蛋白质的仪器。仪器配套DNA,RNA和蛋白质的多款检测试剂盒,可以检测不同灵敏级别和不同分子量的核酸和蛋白,操作非常便宜。与传统凝胶电泳方法相比,可以减少人工实验步骤,只需三步就可以实现样本质控。

该生物分析仪拥有专利数字化评价RNA质量体系:RIN值。可以清晰精准的对RNA质量进行评估,是业内公认的RNA检测金标准。RIN值数字为1到10。 数字越大表示核酸质量越好。 如果我们下游需要做测序的话,我们核酸RIN值必须要大于7,不然我们就会面临测序失败风险。

2100生物分析采用微控流芯片技术,运行和分析软件同一个,简单易操作,可以提供准确的结果,检测核酸浓度,纯度,和完整性。检测会通过独创的芯片来实行,在芯片背后就有着微流孔道。

操作原理

1. 样品自样品孔处沿微通道移动

2. 样品被注入分离微通道

3. 样品组分通过电泳被分离

4. 各组分通过其荧光被检测,并被转换成胶样图像(条带)和电泳色谱图(峰)

不同的样本类型有相对应的试剂盒可以选择。试剂盒中就包含仪器配套的芯片和所有试剂。试剂中包含染料,Gel,Marker和标准品。在第一次使用试剂盒的时候需要把染料和Gel混合,并且涡旋混匀,形成Mix。Mix避光储存在4℃中,这样后续可以继续使用。在正式实验前,所有的试剂必须提前取出,恢复至室温,才能进行下一步操作。


在上机之前需要进行芯片制备。在购买2100生物分析仪的时候会配置芯片工作台。首先需要将芯片放置在芯片工作台上通过针管注入染料胶Mix,整个过程需要等待一分钟,直到Mix注满芯片下方的微孔道。然后我们只需要按照说明书指导开始加样即可。

等芯片制备完毕之后,我们就可以上机检测啦。在电脑上操作也非常简单,新人友好,很容易上手,属于有手就会的简单程度。

第一步:确认芯片是否正确放入仪器

当你的芯片准备就绪的时候,你的软件上就会出现芯片的图案。如果你的软件上出现了其他图案,他们也有各自所代表的含义,需要我们进一步调整。

像下图这样,就表示你已经可以开始进行下一步操作啦。

第二步:选择检测类型

我们可以选取右边的ASSAYS 按键,选择我们检测的类型:DNA,RNA 或者蛋白质检测。

第三步:设置样本信息和选择文件储存位置

我们对样本进行标注或者添加别的信息,设置好储存位置,实验结束后就可以在电脑指定的文件夹里找到我们的Row data。

 

第四步:开始分析

等上述内容都设施妥当之后,我们只需要用鼠标按一下绿色的START按钮,就可以开始我们的检测了。


以单细胞RNA样本为例,我们可以选择胶图或者是电泳峰图进行结果的展示。软件也会显示出样本RNA的RIN值。从图中可以样本在18s和28s有两个明显的峰值,没有过多杂峰,胶图也很清新,没有明显拖带。RIN值等于9.4。 由此可见,这个样本的RNA完整度非常不错。

屏幕对面的你,如果学校或者单位有2100生物分析仪的话,赶紧上车吧!下单试剂盒,轻松做实验,省钱又省心!今天的科普就到这里啦,咱们青山不改,绿水长流!下周见!

更多精彩,可咨询公众号:优宁维分子生物学,进行了解


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