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科研代码分享|生物信息分析之SCI热门图表-火山图

2022-06-13 15:02 作者:尔云间  | 我要投稿

科研有捷径,输入代码,一键获取科研成果!就是这么省事,来具体看下有多方便!

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真香提示:文末可以知道如何获取代码~  

火山图(volcano)是差异分析中最直观的可视化方式,通过火山图可以直观的观察到表达倍数的整体分布和差异显著性的整体分布,因此是做差异分析必备的可视化方式之一。 

利用纯生物信息学分析发表高分SCI,火山图是差异分析必不可少的可视化展示方式。如下图。这是来自Front Cell Dev Biol的一篇IF > 8分生信文章。

文献中的火山图

但是具体要如何实现??? 今天,小编以代码提供的数据为例进行说明。

代码具体包括:

Step1 输入数据(我们需要准备输入数据的三个信息,一个是基因列,用于画火山图时显示基因的名称,一个是 log2的表达倍数,一个是显著性p值或者FDR(看你的需要选择))

Step2 R代码绘制火山图

下面是代码中附带数据绘制的火山图

火山图 


神奇吧,就是如此简单,我们用的都是入门级函数,稍微懂点R语言就能实现。

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