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【文献速递】【Nature methods】【2022年】【1月】

2022-08-12 15:32 作者:Rt_Cola  | 我要投稿

声明:本专栏主要对生命科学领域的一些期刊文章标题进行翻译,所有内容均由本人手工整理翻译。由于本人专业为生物分析相关,其他领域如果出现翻译错误请谅解。

1. FlyWire: online community for whole-brain connectomics

FlyWire:全脑连接组学在线社区

2. Cross-modal coherent registration of whole mouse brains

整个小鼠大脑的跨模态连贯配准

3. Fast optical recording of neuronal activity by three-dimensional custom-access serial holography

通过三维定制访问串行全息术快速光学记录神经元活动

4. Lineage recording in human cerebral organoids

人脑类器官中的谱系记录

5. Rapid, efficient and activation-neutral gene editing of polyclonal primary human resting CD4+ T cells allows complex functional analyses

多克隆原代人类静息CD4+ T细胞的快速、高效和激活中性基因编辑允许进行复杂的功能分析

6. Monitoring protein conformational changes using fluorescent nanoantennas

使用荧光纳米天线监测蛋白质构象变化


基于DNA或者PEG的荧光天线,一端含有荧光基团(比如FAM),另一端含有生物素来促进接触(开始)。我们使用生物素连接纳米天线到含有四个生物素位点的野生型链霉亲和素,可以观察到FAM荧光信号的下降(或者淬灭)。通过和生物素化的小牛肠碱性磷酸酶结合,可以观察到明显的荧光信号(第二步),证明FAM从链霉亲和素上释放。在加入碱性磷酸酶底物后,纳米天线产生了一个暂时的荧光“尖峰”(第三步),可以用来实时监测酶的瞬间底物结合状态。

7. Engineered HaloTag variants for fluorescence lifetime multiplexing

用于荧光寿命多路复用的工程HaloTag变体

8. Systematic molecular evolution enables robust biomolecule discovery

系统的分子进化使强大的生物分子发现成为可能

9. Fast and flexible analysis of linked microbiome data with mako

使用 mako 快速灵活地分析关联的微生物组数据

10. Benchmarking atlas-level data integration in single-cell genomics

在单细胞基因组学中对图谱级数据集成进行基准测试

11. Method of the Year: protein structure prediction

年度方法:蛋白质结构预测

蛋白质结构预测是我们的 2021 年度方法,用于最近开发的基于深度学习的方法,该方法以前所未有的准确度预测结构。在封面上,来自AlphaFold蛋白质结构数据库(https://alphafold.ebi.ac.uk/)的大量蛋白质结构模型由AlphaFold2方法预测。


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