高分网络药理学文章该怎么发？加上实验和多组学，多点开花直接拿到7分+！
说到“网络药理学”，小云知道做中药的朋友们对它是又爱又恨：网药确实是个好的发文途径，可以减少一部分实验成本；但网药已经过了最初的红利期，目前只做网药已经不好发高分文章了··· 针对这种情况，我们该怎么利用网药发高分文章呢？ 下面小云就用2个文章实例，对比总结高分文章发文秘籍~
5分+文章：网络药理学+分子对接+动物实验验证
7分+文章：网络药理学+分子对接+动物实验验证+蛋白质组学+代谢组学
7分+文章：网络药理学+分子对接+体内外实验验证+机制探索实验
这么对比是不是很清晰的就能看出来：
7分+的文章增加了多组学检测或机制探索。这两类思路小云更推荐多组学检测，因为一般这里的组学检测和分析难度都不大，所需样本数量也不多，比机制实验会更简单写，更多是拓宽数据维度和支撑数据量，不同研究目的可以添加不同的组学分析，比如转录组学、蛋白组学、代谢组学、肠道菌群测序等等
。
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下面就用上面那篇7分+添加多组学的文章给小伙伴们详细解析下，多点开花的思路设计~
题目：蒺藜通过调控鞘脂代谢信号通路诱导乳腺癌细胞凋亡
杂志：
Phytomedicine
影响因子：IF=7.9
发表时间：2023年8月
研究背景
蒺藜(TT)最初记载在《神农本草经》中，在中国作为平肝、驱散忧郁和风、促进血液循环、改善视力和止痒的草药使用了几千年，而且在中国古代也是用来治疗乳腺癌的。然而，TT提取物对乳腺癌的药理活性很少受到关注。
数据来源
研究流程
从TCMSP收集TT的成分，确定QLYD的主要活性成分和相应的靶点。利用GeneCards 数据库挖掘乳腺癌和乳炎的潜在治疗靶点，三者靶点取交集获得123个共有靶点。针对共同靶点进行PPI网络分析、GO和KEGG富集分析，构建草药-成分-靶点-疾病网络，并将核心活性成分与核心靶点进行分子对接。建立乳腺癌小鼠模型，研究TT水提物对乳腺癌的治疗作用和靶点机制。最后利用蛋白组学和代谢组学检测筛选了TT治疗后的差异蛋白和差异代谢物，进行功能分析，并针对关键差异蛋白进行免疫荧光表达验证。
主要结果
1. TT的网络药理学分析
在TCMSP中筛选TT的活性成分，获得12个活性成分（图1A）。进一步在TCMSP中搜索这些筛选出的活性成分的蛋白质靶点，共得到127个靶标。在GeneCards 数据库中收集15253个乳腺癌靶标和1225个乳炎靶标，将三者取交集，获得123个共同靶标（图1B）。随后利用Cytoscape建立草药-成分-靶点-疾病网络（图1C），利用String和Cytoscape建立123个共同靶标的PPI网络（图1D）。针对共同靶标基因进行GO和KEGG富集分析（图1E, F），显示基因多富集于TNF信号通路、肿瘤通路、VEGF信号通路等，提示TT可能通过抗炎、抗凋亡等途径治疗乳腺癌或乳炎。将核心活性成分TT7和TT8与核心靶点VEGFR2通过Autodock软件进行分子对接，显示TT7和TT8与VEGFR2之间存在稳定结合（图2B, C）。
2. TT水提物对乳腺癌小鼠的治疗作用研究
首先制备TT水提物，并利用高效液相色谱定量测定水提物中蒺藜苷D的含量。建立4T1乳腺癌小鼠模型，并给予紫杉醇和高中低剂量的TT水提物处理，记录小鼠体重和肿瘤大小。收集肿瘤组织进行HE以评估病理变化，Hoechst染色以评估细胞凋亡。利用WB检测组织中凋亡通路中关键蛋白的表达。结果显示，TT水提物治疗后对小鼠体重影响不大（图3A），但肿瘤大小、重量显著降低（图3B），肿瘤抑制率>26%（图3C）。HE染色显示，TT水提物处理后发现了更多脂肪细胞，并出现核分裂（图3D）。Hoechst染色显示，TT水提物处理后细胞凋亡增加（图3E）。WB结果显示，TT水提物治疗后抗凋亡蛋白VEGFR2, ERK1/2, p-ERK1/2 和 Bcl2表达降低，促凋亡蛋白Bax表达增加（图3F）。
3. 蛋白组学分析
收集TT水提物处理组和模型组的肿瘤组织进行TMT蛋白组学检测，获得495个差异蛋白（图4A）。随后对差异蛋白进行亚细胞定位分析、GO和KEGG富集分析以及PPI网络分析（图4D）。亚细胞定位分析显示，差异蛋白主要位于质膜、细胞核、线粒体、溶酶体和细胞间隙、细胞质中（图4B）。KEGG途径富集分析显示，差异蛋白富集于243条途径（66个上调途径、76个下调途径和101个不确定途径），其中鞘脂代谢信号通路通过降低SPHK 和SPPase表达而下调（图4C）。最后在肿瘤组织中通过免疫荧光测定验证SPHK1、Sgpp1和p-SPHK1的表达（图5）。
4. 代谢组学分析
收集TT水提物处理组和模型组的肿瘤组织进行非靶向代谢组学检测，获得76种差异代谢产物（图6A），并对差异代谢产物进行层次聚类分析（图6B）。
文章小结
这篇文章针对中药（蒺藜）和乳腺癌进行常规网络药理学分析和分子对接，并利用动物实验验证和多组学检测来提升文章质量和创新性，打造出一篇接近8分的干湿结合文章，可见只要做到“多点开花、多路并行”就可以发高分网药文章！小伙伴对网药方向感兴趣的话，小云真诚建议大家用上这个发文秘籍，下一篇发表高分网药分析文章的就是你啦！
