各样本外泌体提取
一、细胞外泌体提取(以MSC为例)
I. 准备
1) 将P3-P4 MSC 培养至70%-80%密度,10cm dish 或者T75装10ml Mediium;T175装25ml/瓶
2) 厚壁超速离心管清洗后高温高压灭菌备用(勿烘干),高速离心管及超离管盖、薄壁超离管用70% 乙醇浸泡20min消毒,然后用无菌PBS润洗晾干。
II. Conditioned medium的收集和处理
实验试剂: IMDM、PBS
准备耗材:灭菌好的EP管、灭菌好的玻璃瓶、50ml离心管、500ml玻璃瓶(无菌)
实验仪器:冷冻离心机、迷你离心机
实验步骤:
1. 将细胞培养至密度达到70%-80%满(超离一次可最多离心240ml,即24个10cm Dish or 10个 T175)
2. 弃去培养基,PBS润洗2次;
3. 换成同等体积的IMDM(如果需要加药处理,则在Conditioned medium更换前进行预处理)
4. 培养箱继续培养48小时 (不同细胞不一样,如生长较快的细胞,培养24小时即可)
5. 用移液管将conditioned medium收集到50ml离心管中,300g 4度离心10min(去除死细胞)
6. 利用移液管收集上清至干净50ml 离心管中,4℃保存最长1周或置于-80℃保存,或直接进行外泌体提取)
注意:conditioned medium收集后应尽快进行外泌体的提取,保存时间长会损失一些外泌体,也有研究者保存于-80度中数个月再提取外泌体。
补充:以下是全细胞裂解液的制备(total cell lysate)(用于外泌体免疫分析时作为对照组)
1. 用胰酶消化1-2个培养皿的细胞并进行计数;
2. 将1-5×107细胞装在小型离心管中(EP管)中,300g 4℃ 离心5min,弃上清,重悬在1ml 预冷的PBS中,再次离心并重悬在1ml 冷PBS中进行清洗,再离心弃上清;
3. 加200μl (for 1 × 107 cells) 或 1-ml (for 5 × 107 cells) 细胞裂解液,冰上孵育20min,孵育开始时和结束时涡旋混匀。(改为超声30s后50%pulse冰上轻摇15min,2016.01.29)
4. 20,000g 4℃离心20min(改为14,000g 4℃离心15min),收集上清至干净的微型离心管(EP管)中,-20℃保存最多6个月。
III.外泌体的提取
实验试剂:处理好的细胞培养基(Conditioned medium) PBS
实验仪器:离心机 离心管 -80°冰箱
实验步骤:
1. 将实验2中收集处理好的干净conditioned medium装入50ml离心管中
2. 2000g 4℃离心20min
3. 用移液管吸取上清转移至高速离心管中(注意不要污染,留下0.5厘米的上清不要吸)
4. 用记号笔标记高速离心,标记面朝上放置,16500g 4℃离心30min
5. 用移液管吸取上清至新的超速离心管(Type 50.2)里(盛0.5cm液面时就不要吸了)
6. 120,000g 4℃离心最少70min
注意:本步骤超速离心应保证每个离心管均至少有3/4液体,若不足,则应加PBS补足;时间超过70min(不超过3小时)并不会破坏exosome,即保证100000g离心大于60min
7. 完全弃除上清
注意:如为固定角度的转子,则本步骤可以倾倒弃除上清;如为悬吊式转子,则应用移液管吸弃上清,最后剩2mm液面即可
8. 在每管离心管中加入1ml 预冷PBS,用微量移液器(micropipettor)将沉淀重悬,将同一组细胞的管子的液体混合放到同一个超速离心管(Type 50.2或SW41均可)里,再加入PBS补足管内体积。
注意:本步骤可能并不能肉眼看见沉淀物
9. 120,000g 4℃离心60min
10. 尽可能地弃除上清液,用移液管和微量移液器缓慢弃去上清
11. 重悬沉淀(即exosome):加少量(100μl/6 10cm dish)的预冷PBS重悬
12. 分出10ul装于新EP管用于测量蛋白浓度,剩余可100μl/EP管分装成小管-80℃冰箱保存
参考文献:Thery C, Amigorena S, Raposo G, Clayton A. Isolation and characterization of exosomes from cell culture supernatants and biological fluids. Curr Protoc Cell Biol. 2006 Chapter 3:Unit 3 22
二、植物外泌体的提取
1. 对于多汁植物,清洁外皮,使用挤汁器榨汁;对于少汁植物,切成6mm×6mm×6mm左右的小块,使用榨汁机榨汁。收集到50ml离心管中。每次提取需集满4个50ml离心管。
2. 照217的超净台。以 3000g 30min 4℃离心以去除死细胞,收集上清液至高离管(4管→6管)。
3. 以 10000g 60min 4℃离心以去除细胞碎片。收集上清液。
4. 以 150000g 90min 4℃离心,保留沉淀。每管用2ml 8%蔗糖溶液重悬。
5. 可配制4~6管蔗糖梯度溶液(自上而下15%、30%、45%、60%,各1.5ml)。务必轻柔操作,以形成分层。
6. 继而轻柔加入有蔗糖梯度溶液的超离管中。
7. 以 150000g 90min 4℃离心,保留可见的各组分(若能看到条带,则吸取之;否则,两组分均收集。实际使用时选择15/30%和[或]30/45%的)。
8. 剩余100 ul用作NTA/TEM检测,放入-80℃。
三、动物血清外泌体的提取
1. 获得血浆:新鲜的全血1600g 20min 4℃离心。通常将1~2ml血浆作为一个样本。
2. 血浆10000g 30min 4℃离心,去掉细胞碎片等。下接3.1或3.2。
3. 1 上清稀释至~6ml,加入Quick-seal超离管(#344619),100000g 70min 4℃离心×2。
3. 2 或使用SBI的试剂盒(例如血清是EXOQ5A),按比例加入后低俗离心即可见沉淀。
4. 上接3.1或3.2。用100ul/超离管预冷的PBS稀释,充分吹打。