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在超算平台安装高斯16(Gaussian16 for Linux)

2022-07-17 21:21 作者:光声电子  | 我要投稿

(以北京超算为例)

1. 上传安装包(G16-A03-AVX2.tbz),并解压:

    tar -jxvf G16-A03-AVX2.tbz

 

2. 解压完成会自动生成g16文件夹,在该目录下新建scratch文件夹:

       mkdir scratch

 

3. 给g16和scratch文件夹分别赋予权限:

       chmod -R 750 ./g16

       chmod -R 777 ./scratch

 

4. 修改系统环境变量:

       vi ~/.bashrc

 

在bashrc文件中加入以下内容:

    # Gaussian-16

    export PATH=/public1/home/......./bin:$PATH

    GAUSS_SCRDIR=/public1/home/......./Gaussian/scratch

    g16root=/public1/home/....../Gaussian/gaussian

    export g16root GAUSS_SCRDIR

    source $g16root/g16/bsd/g16.profile

 

5. 由于当前高斯版本与北京超算的CPU架构有冲突,故需在环境变量中加入如下内容:

    export PGI_FASTMATH_CPU=haswell

 

6. 查看g16是否装好:

    which g16

 

出现类似如下内容说明安装完成:

    ~/Gaussian/gaussian/g16/g16

 

7. 使用脚本提交作业:

    略



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