在超算平台安装高斯16(Gaussian16 for Linux)
(以北京超算为例)
1. 上传安装包(G16-A03-AVX2.tbz),并解压:
tar -jxvf G16-A03-AVX2.tbz
2. 解压完成会自动生成g16文件夹,在该目录下新建scratch文件夹:
mkdir scratch
3. 给g16和scratch文件夹分别赋予权限:
chmod -R 750 ./g16
chmod -R 777 ./scratch
4. 修改系统环境变量:
vi ~/.bashrc
在bashrc文件中加入以下内容:
# Gaussian-16
export PATH=/public1/home/......./bin:$PATH
GAUSS_SCRDIR=/public1/home/......./Gaussian/scratch
g16root=/public1/home/....../Gaussian/gaussian
export g16root GAUSS_SCRDIR
source $g16root/g16/bsd/g16.profile
5. 由于当前高斯版本与北京超算的CPU架构有冲突,故需在环境变量中加入如下内容:
export PGI_FASTMATH_CPU=haswell
6. 查看g16是否装好:
which g16
出现类似如下内容说明安装完成:
~/Gaussian/gaussian/g16/g16
7. 使用脚本提交作业:
略