五、GO和KEGG分析

1.DAVID（https://david.ncifcrf.gov/）

（2）将药物-疾病靶点交集复制进“A：Paste a list”，“Step 2：Select Identifier”项下选择“OFFICIAL_GENE_SYMBOL”，“Step 2a：Select species”项下选择“Homo sapiens”，“Step 3：List Type”项下选择“Gene List”，点击“Submit List”。

（3）展开“Gene_Ontology”，点击“GOTERM_BP_DIRECT”后的“Chart”。

（4）右键“Download File”，点击“将链接另存为”，选择保存位置，命名文件，点击“保存”。

（5）“GOTERM_CC_DIRECT”“GOTERM_MF_DIRECT”同上。

（6）展开“Pathways”，“KEGG_PATHWAY”同上。

（7）打开下载的文件，复制到EXCEL。（若复制完只有一列，则选择分列时只勾选“Tab键”，若有多列但分列混乱，则点击“文件”→“打开”→选择下载的文件→“打开”→“下一步”，只勾选“Tab键”即可。）

（8）选中“Count”一列，右键选择“插入”。

（9）复制“Term”栏目下“GO:0008284~positive regulation of cell proliferation”中的“~”。注：KEGG为复制冒号。

（10）选中“Term”栏，点击“数据”→“分列”。

（11）点击“下一步”，勾选“其他”，在后面粘贴上之前复制的“~”，点击“下一步”，点击“完成”。

（12）将新分列出的一列前20个数据复制到新EXCEL表格中。

（13）将表格中“PValue”、“Count”的前20项复制到新EXCEL，并按下图排列。其中“GeneRatio”数据为“Count”除以“List Total”。CC、MF、KEGG同上。

2.微生信（https://www.bioinformatics.com.cn/）

（1）注册登录后，点击“富集气泡图”。

（2）将上一步整理好的BP数据复制进“绘图数据”。

①调整“图像大小”项下的“图片宽度”为合适大小；

②在“图标题”处输入“BP”；

③“X轴说明”处输入“GeneRatio”；

④“颜色”选项下选择“颜色代表的p值进行-log10转化”，并选择合适的颜色；

⑤“字体”选择“Times New Roman”；

⑥点击“提交”。

（3）点击“PNG（300 dpi）”，下载保存即可，CC、MF、KEGG同上。