快来学！你不知道的TSS富集热图中的小细节
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一文搞定TSS富集热图
今天小果有点忧伤，为什么论文里面的TSS富集图那么美观，小果的却略显丑陋呢
下面是论文中的TSS富集图，大家欣赏一下
下面呢则是相比起来略显不行的小果做的TSS富集图，大家欣赏一下
不比不知道，一比吓一跳！
小果做的图里面有很多的”黑线”，十分影响美观!
这可怎么办呢，小果赶紧又去仔细阅读了deeptools的帮助文档
上面几个参数是小果仔细阅读之后发现有可能影响“黑线”的关键参数，不过小果感觉一个一个去实验太麻烦了，只能去求助万能的度娘，里面有小伙伴说出现黑线是因为在使用computeMatrix形成矩阵文件没有添加参数--missingDataAsZero！小果没有想到是因为形成矩阵文件的问题，幸亏小果没有一个个参数实验，那怕不是白白浪费时间！
在了解到了问题所在之后，小果快马加鞭去实验了一下，下面是小果的使用computeMatrix命令形成矩阵文件的参数：
下面是参数的解释：
下面是missingDataAsZero 参数的官方解释，大家可以试着理解一下嗷
下面来欣赏一下小果新的TSS富集热图吧
果然没有了黑线，是不是比之前更美观了呢？
今天的关于TSS富集热图的小细节学习就到这里啦，感兴趣的小伙伴可以找小果讨论哦，我们明天见咯~
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