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利用ORCA在天河二号上并行计算

2021-05-16 23:22 作者:光声电子  | 我要投稿

(本文使用的orca版本为4.2.0;openmpi版本为3.1.4;广州超算)

1. 准备算例,如下:

%pal nprocs 4

end

! HF SVP

* xyz 0 1

C 0 0 0

O 0 0 1.13

*


2. 进入算例目录,输入vi orca.sh并回车,进入脚本编写页面;按i进入编辑模式,输入以下内容,确认无误后按esc退出编辑模式,输入:wq保存内容并退出脚本编写页面

#!/bin/bash

source /WORK/app/toolshs/cnmodule.sh

module purge

module load openmpi/3.1.4

export PATH=/orca安装路径/:$PATH

/orca绝对路径/orca CO.inp > CO.out


3. 输入sinfo查看分区及节点,如下图;可用分区名为work



4. 输入yhbatch -N 1 -p work orca.sh命令提交作业脚本,其中-N用于指定节点数,默认为1;-p用于指定分区,work是分区名称;orca.sh是上面建立的脚本名称



5. 输入squeue并回车,查看任务运行状态



6. 计算完成会生成如下几个文件,用记事本打开out文件,最下面出现ORCA TERMINATED NORMALLY说明计算完成,没有出错







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