欢迎光临散文网 会员登陆 & 注册

TBtools | 批量计算蛋白分子量、等电点、不稳定系数、脂溶指数和亲水指数

2023-08-29 15:34 作者:蜉蝣无所  | 我要投稿

注:原文为陈程杰老师编辑,此处仅为记录。

原文地址:www.jianshu.com/p/847f0c597405


Expasy网站中的ProtParam程序可进行蛋白分子量、等电点、不稳定系数、脂溶指数和亲水指数分析,但该程序仅能单个序列进行分析,CJ-Chen在TBtools上推出Protein Paramter Calc爬虫程序,可实现批量蛋白序列处理,但该程序为避免Expasy网站服务器崩溃,对其进行限速,我对比了150条序列,大概耗时3 min。与Expasy网站结果对比检测,TBtools跑出的结果没有问题,二者完全一致。

使用路径:

TBtools软件中Other——Phylogenetics——Protein Paramter Calc (ProtParam-based)

使用方法:

输入蛋白序列,输出文件,compute,等待。

TBtools | 批量计算蛋白分子量、等电点、不稳定系数、脂溶指数和亲水指数的评论 (共 条)

分享到微博请遵守国家法律