双硫死亡的第一篇生信分析文章已接收!疾病分型+预后模型思路,外加单细胞数据分析,

2023年2月份提出了双硫死亡这一新型的细胞死亡类型:

“双硫死亡”是什么?
在葡萄糖缺乏的SLC7A11-high癌细胞中,大量积累的二硫化物分子导致肌动蛋白细胞骨架蛋白之间的异常二硫化物键合,干扰其组织,最终导致肌动蛋白网络崩溃和细胞死亡。这种二硫化物应激诱导的全新细胞死亡方式被命名为Disulfidptosis,双硫死亡。
遵循铁死亡、铜死亡的发展规律,新方向刚一爆出,第一波发文肯定是生信分析!
这不,还不到2个月的时间,第一篇“双硫死亡”的生信分析文章已经被接收了!

而且从投稿情况看,作者在双硫死亡提出之后的1个月内,就完成了分析内容和文章的撰写,充分利用了生信分析“发文周期短”的优势,以最小投入抢发高分生信文章!
虽然目前还没看到这篇文章的全文内容,但是我们可以从摘要看一下大体分析内容。

(1) 作者分析了4个双硫死亡相关基因(DRGs)在普通转录组和单细胞数据中的表达和突变特征;
(2) 通过一致性聚类鉴定出2个DRGs聚类,分析两个聚类中的差异表达基因(DEGs);
(3) 利用机器学习算法选择DEGs构建与双硫死亡相关的预后模型(DRPS),计算风险评分。
(4) 分析高、低风险组在临床特征、突变格局、免疫细胞浸润和免疫治疗疗效预测方面的差异。构建nomogram。利用肿瘤免疫功能障碍和排斥反应(TIDE)和IMvigor 210队列验证了DRPS是否预测患者对免疫治疗的反应。
总结分析思路属于:基于热点基因集进行疾病分型+预后模型思路,同时加入了单细胞数据的分析。

小云之前给大家总结了双硫死亡的8种生信分析切入思路,其中提到了类似的分析思路:


如果想要了解这篇“双硫死亡”的生信内容具体是如何分析的,可以参考下面这篇铜代谢的文章,分析内容大体一致:


除了这个分析思路,双硫死亡的生信还有很多其他的角度可以切入,感兴趣可以点击文末文章链接,回顾一下小云之前整理的双硫死亡8种可做的思路,新热点红利期千万不要错过,想第一波吃螃蟹的生信人抓紧上车啦!!

小伙伴们可以根据自己的发文分数、周期等等要求综合评估,选择合适的思路上车,想要周期短能快点发出来的,建议分析思路比较成熟的纯生信思路;想要发比较高分的,建议选进阶版纯生信(加入了创新的分析内容)或干湿结合思路。不管用哪种思路,都要趁着新热点的黄金抢发期,快快行动起来!比的就是谁更快~
