时空日报 | 新干细胞调节因子DOT1L控制顶端祖细胞分化
大家好，欢迎观看《时空日报》第4期。本期追踪到时空/单细胞组学相关研究文章共计6篇。以下是应用华大时空StereoCopilot生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
1：DOT1L活性影响神经干细胞分裂模式并减少分化和ASNS表达
DOT1L activity affects neural stem cell division mode and reduces differentiation and ASNS expression
EMBO Reports; IF: 9.071; DOI: 10.15252/embr.202256233
内容概要：联合谱系追踪和scRNA-seq，研究组蛋白甲基转移酶DOT1L的酶活性对顶端祖细胞（apical progenitors，APs）分裂方式的表观遗传调控，发现DOT1L活性/PRC2相互作用通过调节天冬酰胺代谢来控制AP谱系分化。
2：MATR3-反义LINE1 RNA网络支架构建高级染色质组织
MATR3-antisense LINE1 RNA meshwork scaffolds higher-order chromatin organization
EMBO Reports; IF: 9.071; DOI: 10.15252/embr.202357550
内容概要：通过研究核基质蛋白MATR3和反义LINE1（AS L1）RNAs之间的相互作用，发现它们通过相分离形成了一个网状结构，提供了一个动态平台来组织染色质的空间结构。该研究揭示了MATR3和AS L1 RNA形成的网状结构在细胞核中聚集染色质的作用。
3：通过多模态高阶邻域拉普拉斯矩阵优化实现多组学单细胞数据的稳健联合聚类
Robust joint clustering of multi-omics single-cell data via multi-modal high-order neighborhood laplacian matrix optimization
Bioinformatics(Oxford, England); IF: 6.931; DOI: 10.1093/bioinformatics/btad414
内容概要：提出了一种名为scHoML的多模态高阶邻域拉普拉斯矩阵优化框架，用于整合多组学单细胞数据。该方法通过集成高阶和多模态拉普拉斯矩阵，能够稳健地表示复杂的数据结构，并允许在多组学单细胞水平上进行系统分析，从而促进进一步的生物学发现。
4：单细胞转录组学揭示CD70表达对CAR-70 T细胞产生和功能的影响
Revealing the impact of CD70 expression on the manufacture and functions of CAR-70 T-cells based on single-cell transcriptomics
Cancer Immunology, Immunotherapy; IF: 6.630; DOI: 10.1007/s00262-023-03475-7
内容概要：基于抗CD70嵌合抗原受体修饰（CAR-70）T细胞，构建了CD70敲除和野生型CAR（CAR-70KO和CAR-70WT）T细胞，结合scRNA-seq，发现敲除CD70可以防止CAR-70 T细胞的耗竭，并提高CAR T细胞产品的质量。
5：PTEN突变皮质类器官的细胞类型特异性缺陷集中于异常电路活动
Cell-type specific defects in PTEN-mutant cortical organoids converge on abnormal circuit activity
Human Molecular Genetics; IF: 5.121; DOI: 10.1093/hmg/ddad107
内容概要：使用来自不同供体的人类皮质类器官，通过scRNA-seq、蛋白质组学和空间转录组学对单个类器官进行分析，揭示了PTEN杂合性的供体依赖的、细胞类型特异性的发育表型，这些表型随后集中在受损的神经元活动上。
6：将激素受体表达定位到特定细胞区域的特发性声门下狭窄症
Localizing hormone receptor expression to cellular compartments in idiopathic subglottic stenosis
The Laryngoscope; IF: 2.600; DOI: 10.1002/lary.30856
内容概要：使用已建立的特发性声门下狭窄（idiopathic subglottic stenosis，iSGS）scRNA-seq细胞图谱定位雌激素受体（ESR1和ESR2）和孕激素受体（PGR）的细胞特异性基因表达，发现在iSGS患者的气道瘢痕中，近端气道黏膜内分泌受体主要由成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞表达，其中成纤维细胞表达ESR1和PGR，免疫细胞表达ESR1和ESR2，而内皮细胞主要表达ESR2，这为进一步研究激素依赖性机制在iSGS病理发生中的作用奠定了基础。
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