双十一送惊喜 | 博奥晶典单细胞生信云平台CellScope账号免费送
经过漫长的课题设计、样本收集、组织解离和建库测序之后,单细胞实验环节终于落下帷幕。科研君们终于长长地松了一口气,念峥嵘岁月,叹课题多艰。然而,他们很快发现,前方会面临下一个更艰巨的问题: 这单细胞数据这么多,要怎么分析啊? 我是不是得学 Linux、Python、R…. ? 这个 Seurat 的包要怎么用??我画的图怎么没有文献上的好看???

在此情急之刻,博奥晶典强势推出了无代码一键式单细胞数据可视化及高级分析的软件 —— CellScope。

于是乎,有科研君惊呼:吾盼无代码一键式单细胞分析,如大旱望甘霖!
1. 什么是CellScope?
CellScope 是博奥晶典用于单细胞生物信息学分析的交互式云平台,可轻松实现单细胞高级分析,自由调整结果图的颜色风格,输出发文级精美图片。从此单细胞数据分析无需敲代码,打开网页一键点击即可搞定。

图1. CellScope 登录页面,输入账号和密码,即可开启分析
2. 为什么用 CellScope?
在自己进行生信分析或者与生信分析人员沟通的过程中,通常会遇到各种各样的问题,令人头大。CellScope 就是针对单细胞测序数据分析的难点和痛点来研发的一键式无代码分析平台,将难点一一击破,致力于将单细胞分析向标准化、简单化、个性化发展。
1. 单细胞分析难点:需要学习 Linux、R、Python 等语言
CellScope 解决方案:无代码一键式分析,操作简单,方便快捷
将单细胞表达矩阵数据上传至 CellScope,即可开启一键分析模式。CellScope 网页界面友好,操作简便,分析内容多样,查看结果方便。您无需费力学习各类语言,不必掌握大量生信代码即可放心实现单细胞数据的高级分析。

Linux 系统

CellScope 网页
图2 CellScope 界面友好,操作简便,不需要学习代码
2. 单细胞分析难点:每种个性化分析都要重新学习对应的软件包
CellScope 解决方案:不需要学习对应软件,只需一键点击即可
单细胞的分析软件往往是由多个软件包构成,即使您在已经掌握大量生信代码的前提下,也需要耗费大量精力研究清楚每个分析语句的具体含义、更改参数引起的结果变化以及出现报错时候的 Bug 来源等。CellScope 针对每个分析软件设置独立的分析流程,您无需理解每个软件包和每个分析语句的含义即可顺利开展单细胞生信分析。

使用 Seurat 进行细胞聚类

使用 CellScope 进行细胞聚类
图3 CellScope 只需一键点击即可开始分析
3. 单细胞分析难点:与生信人员沟通困难,所得非所需
CellScope 解决方案:想要什么自己来点,规避无效沟通
在单细胞数据分析过程中,经常会碰到针对某个亚群进行单独分析的情况,此时需要与生信分析人员仔细沟通所用的细胞类群,一旦没有沟通到位,使用的数据出错,即便已得出结果也不能使用,还需要重新返工。使用 CellScope 自主分析就绕过了繁琐的沟通过程,一键分析,不会出错。
4. 单细胞分析难点:用不同的参数做多次分析,会重复收费
CellScope 解决方案:想换什么参数点击即可更换
在单细胞数据分析时,参数的变化会带来不同的分析结果。在不了解代码的情况下,我们想要获得最完善的结果,呈现最满意的结果图就只能望洋兴叹。CellScope 将分析所需调整的参数直接做成交互式窗口,您可以根据需求自行调整参数值,以达到最佳的分析结果。

图4 CellScope 可一键修改参数
5. 单细胞分析难点:售后不到位,无法满足分析需求
CellScope 解决方案:几十种小工具可供选择,包揽大多数单细胞常用分析
CellScope 现已包含 30 多项高级分析工具,如重分群聚类、拟时序分析、细胞互作分析、Single R 注释、GSVA 富集分析、小提琴图、marker 基因热图、GO 富集分析、KEGG 富集分析、细胞比例分析等超高频使用的分析模块。以上分析工具基本已经涵盖目前单细胞文献中的所有分析内容,拥有 CellScope 在手,各类分析无忧!


图5 CellScope 分析工具示例
6. 单细胞分析难点:代码不熟悉,画出的图配色和排版不美观
CellScope 解决方案:图片采用专业配色方案,直接达到发文需求
在阅读单细胞经典文献的时候,我们经常感叹文献中的配图明显比自己项目的图片好看,那么好的实验结果不能匹配一张精美的图片,就如同一位等待相亲的妙龄美女没有一身好看的华裳,实在是莫大的遗憾。CellScope 可以随意调节图片的配色、大小、排版等,使您的结果图片直接达到发文级别。

图6 CellScope 中可以随意调节图片配色、大小、排版等设置

CellScope 细胞分群注释图示例

Cell 文献中的分群图示例

CellScope 中细胞互作分析

文献中的细胞互作分析
图7 CellScope 产出文章发表等级的图片
3. 总结
生信分析是一个工具,归根结底,我们的目的是使用这个工具,发掘更深的科学问题,寻找更便捷、更能满足客户需求的解决方案。
表1 CellScope 单细胞生信分析云台解决方案总结

为了回馈客户,博奥晶典特推出“单细胞生信云平台 CellScope 账号免费送” 活动,细则如下:
单细胞生信云平台
CellScope 账号免费送
·活动时间截止到2022年12月31日;·活动内容1. 2022 年度内,在博奥晶典开展单细胞转录组测序的样本数量累计超过 20 个的客户,博奥晶典将免费赠送价值 120000 元的单细胞生信云平台 CellScope 账号一个。2. 2022 年度内,在博奥晶典开展单细胞转录组测序的样本数量累计超过 8 个,可以免费试用账号 1 个月。3. 同时,博奥晶典将提供以下更多福利:(1)免费参加培训并免费领取 CellScope 各类单细胞高级分析工具操作教学视频;(2)每月定期培训答疑。
·活动内容参与活动请联系博奥晶典当地销售报名。数量有限,报名从速!
博奥晶典科研服务事业部 曹巾帅丨文案
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