蛋白定量质谱

蛋白定量质谱就是利用质谱技术进行蛋白质含量分析，其基于所检测到的肽段离子的质谱峰强度结合理论数据库以及生物信息学分析方法来计算蛋白质的含量。根据质谱数据采集方式可以将蛋白质定量方法分为DDA策略和DIA策略，DDA策略采用数据依赖型扫描模式对质谱数据进行采集，尽可能多的收集全部母离子的碎片信息，是一种非靶向定量技术，Label Free、SILAC、TMT以及iTRAQ等技术就是典型的基于DDA模式的蛋白质定量技术。DIA策略采用数据非依赖型扫描模式对质谱数据进行采集，是一种靶向定量蛋白质技术，该方法对质谱仪的分辨率等性能要求更高，定量结果也更准确，SWATH定量技术就是典型的DIA蛋白质定量技术。