基因工程简答题
1、碱裂解所需试剂及各自作用
1.(单选题,10 分) 碱裂解法提细菌质粒 solution I 说法错误的是:
A.葡糖糖的作用是防止细菌快速沉淀
B.Tris 的作用是提供适当的 pH 缓冲体系
C.EDTA 是为了去除二价金属离子,抑制核酸酶活性
D.solution I 要现用现配
答案解析:选择、判断、碱裂解所需试剂及各自作用(简答)
2.(单选题,10 分) 碱裂解法提细菌质粒 solution II 说法错误的是:
A.solution II 配置好以后要低温储存
B.氢氧化钠的作用是让蛋白质和 DNA 变性
C.SDS 的作用是溶解细胞膜并与蛋白结合,为下一步沉淀做准备
D.操作要快且温和,防止 DNA 断裂
答案解析:选择、判断、碱裂解所需试剂及各自作用(简答)
3.(单选题,10 分) 碱裂解法提细菌质粒 solution III 说法错误的是:
A.醋酸是为了中和碱性
B.醋酸-醋酸钾是为了提供缓冲液体系
C.钾离子可以和 SDS 反应生成不溶物
D.PDS-组蛋白-基因组可以一起从水溶液中去除
答案解析:选择、判断、碱裂解所需试剂及各自作用(简答)
4.(单选题,10 分) 碱裂解法提细菌质粒一些其他试剂说法错误的是:
A.溶菌酶可以用于水解细菌细胞壁
B.DNA 不溶于乙醇,可以利用乙醇沉淀
C.氯仿可以抢夺蛋白表面水分子,使蛋白质变性析出
D.异戊醇有助于消除气泡和维持相的稳定
答案解析:选择、判断、碱裂解所需试剂及各自作用(简答)
2、蓝白斑筛选的基本原理(α互补)
⭐ 在筛选平板上接种转化后大肠杆菌,长出的蓝色菌落是不含目的基因、转化成功的大肠 杆菌。白色菌落是含目的基因的、转化成功的大肠杆菌。而没有成功转化任何一种质粒 的大肠杆菌,会因不携带抗性基因无法在筛选平板上存活。 蓝白斑产生的原理是:大肠杆菌天生能生成β-半乳糖苷酶,转化 X-Gal 为蓝色可溶性物 质,使得菌落呈蓝色。 但用于蓝白斑筛选的大肠杆菌是β-半乳糖苷酶缺陷型菌株。需要质粒、大肠杆菌二者共 同的产物,才能生成β-半乳糖苷酶。但质粒与β-半乳糖苷酶相关的基因上,有目的基因 插入的多克隆位点。因此,但载体与目的基因正确结合,β-半乳糖苷酶也无法正常生成。 根据这样的原理,我们可以根据蓝白斑区分转化成功、含正确重组质粒的菌落。
3、氯化钙转化法/冻融转化法/热激转化法的原理
利用钙离子中和 DNA 分子和细胞膜所带负电荷(降低双电层厚度),并利用低温低渗 的氯化钙溶液,让细胞处于球形(比表面积最大),从而吸附更多 DNA,即该状态下 细胞处于感受态。瞬时加热处理(热激)可以导致细胞膜快速膨胀出现缝隙,从而使细 胞表面吸附的 DNA 进入细胞,完成转化。因关键试剂是氯化钙,所以称氯化钙法;又 因有热激这一关键操作,也称热激法;又因感受态细胞储存时处于冷冻环境,使用时融 化,又称冻融法。
4、基因工程中,对于转化子的初筛、复筛各有哪些原则,可以分别用什么实验 方法达到目的⭐ 初筛——排除无载体宿主细胞——抗性基因、营养缺陷型
初筛——排除空载体转化子——双抗平板对比生长(影印法)、蓝白斑筛选、以赭石突 变为基础的颜色变化(酵母)、以琥珀突变为基础的颜色变化(酵母)、植物报告基因 筛选(GUS、GFP)
验证初筛结果——基于电泳的初步检测——提取原始/重组质粒比较大小、酶切原始/重 组质粒比较大小上的差别、对目的基因进行 PCR
验证初筛结果——基于杂交的进一步检测——利用 DNA 或 RNA 探针进行杂交验证、菌 落原位杂交
验证初筛结果——决定性证据——测序 复筛——基于实验目的的优选——直接利用实验目的筛选
复筛——目标蛋白是否存在的初步判断——蛋白电泳观察是否出现新条带或者目标位 置蛋白是否浓度提高显著
复筛——目标蛋白是否正确——western blot、菌落原位杂交、蛋白质谱
5、“转化”的基本过程 转化的基本过程:
(1)供体菌 dsDNA⽚段与感受态体菌细胞表⾯的膜连 DNA 结合蛋 ⽩相结合,其中⼀条链被核酸酶切开和⽔解,;另⼀条进⼊细胞。
(2)来⾃供体菌的 ssDNA ⽚段被细胞内的感受态特异的ssDNA结合蛋⽩相结合,并使ssDNA结合蛋⽩相结合,并且 使 ssDNA 进⼊细胞,随即在 RecA 蛋⽩的介导下与受体菌核染⾊体上的同源区段配对,重 组,形成⼀⼩段杂合 DNA 区段。
(3)受体菌染⾊体组进⾏复制,于是杂合区也跟着得到 复制。
(4)细胞分裂后,形成⼀个转化⼦和⼀个仍保持受体菌原来基因型的⼦代。
5、A-T 克隆的优缺点
优点:
(1)AT 克隆可以利用 Taq 酶在基因两端添加的单个脱氧核糖核苷酸 A 与线性载 体两端的单个脱氧核糖核苷酸 T 的互补配对完成快速的载体构建。
(2)AT 克隆可以将目的基因的插入位点放置在 LacZ’基因内部,从而利用蓝白斑筛选 快速完成阳性克隆筛选,可以避免载体自连带来的干扰。
缺点:
(1)AT 克隆不能规定目的基因在载体上的插入方向。
(2)AT 克隆不能避免载 体自连。
6、定向克隆的优缺点
优点:
(1)可避免载体和基因的自身环化。
(2)固定了基因在载体上的插入方向。
缺点:
(1)酶切位点不易找到。
(2)多体系完成(酶切载体、酶切目的基因、连接切 好的载体和基因)。
(3)酶切产物需要纯化才能进行连接,增加了实验的复杂性(内 切酶只切割 DNA 磷酸二酯键,不纯化切下的 DNA 单链会粘附在粘性末端,从而降低杂 合 DNA 分子的数量)
7、单酶切/平末端酶切载体构建法的优缺点
优点:
(1)酶切位点易选泽
(2)平末端目的基因基本无需改造(单酶切需要改造,添 加酶切位点)。
(3)酶切后载体、基因无需纯化即可进行连接操作
缺点:
(1)目的基因、载体自身环化和线性化连接概率高
(2)连接效率低(酶和底物 随机碰撞概率低)
8、去磷酸化克隆法的优缺点
优点:
(1)排除了载体自连的可能性,提高了杂合重组率
(2)降低了基因线性聚合的 概率,平板上生长的含杂合质粒的转化子概率高(目的基因自连成环的不能复制)
缺点:
(1)去磷酸化不能固定基因插入方向,可能有反向插入
(2)增加了去磷酸化这 一步骤,可能降低成功率
(3)只能选择去磷酸化载体和基因中的一个(另一个需要保 留磷酸基团用于连接),通常选择去磷酸化载体,导致目的基因仍有环化可能性,降低 了连接效率。
9、无缝克隆的优缺点
优点:
(1)基因插入位点选择灵活,不受酶切位点限制。
(2)省略酶切、切胶、连接 过程,反应单体系完成,操作快捷。
(3)基因以固定方向插入载体。
(4)多片段连接 效率高。 缺点:通常需要商品化试剂盒,成本高。
10、物质的污染 衡量所提取 DNA 的纯度可用 OD260 与 OD280 的比值,OD260/OD280 对 DNA 而言其值 大约为 1.8,那么当 OD260/OD280 大于 1.9 则可能有( RNA )污染,当 OD260/ OD280 小于 1.6 时则有( 蛋白质 )污染,同理,对 RNA 而言 OD260/OD280 值 大约为 2.0,当 OD260/OD280 大于 2.1 则可能有( 异硫氰酸胍 )污染,当 OD260/ OD280 小于 1.9 时则有( DNA )污染。
8.(单选题,10 分) 关于双脱氧测序和 DNA 复制的异同,描述错误的是:
A.双脱氧测序和 DNA 复制用的都是 DNA 聚合酶
B.双脱氧测序和 DNA 复制都需要引物
C.双脱氧测序和 DNA 复制都必须有变性-退火-延伸三个步骤的多次循环
D.双脱氧测序和 DNA 复制的主要差异之一在前者的反应底物是 dNTP 和四种 ddNTP, 而后者只需要 dNTP