如何读取质粒图谱

什么是质粒图谱

质粒图是质粒的图形表示，它显示了质粒的主要地标或元素的位置。质粒中元素的相对位置可以通过限制性映射来识别。限制性图谱是特定质粒内限制性识别位点的图谱。因此，它参与限制性内切酶对质粒的消化。限制映射如图 1 所示。

图 1：限制映射

在限制映射中可以使用两种方法：

1.限制性酶切：

• 用一种或两种限制性内切酶限制性酶对质粒进行限制性酶切化

• 根据质粒产生的片段大小映射质粒

2.测序：

• 对整个质粒进行测序

• 鉴定质粒的元素

如何读取质粒图谱

图2：质粒图

质粒图谱的读取主要集中在质粒的特征上。他们是：

1. 质粒的名称和大小

• 质粒的名称和大小在圆形质粒的中间标明。
  

2. 质粒的元素 –

• 复制起源 – 通过招募细菌转录机制参与启动复制的DNA序列。
  

• 抗生素抗性基因 – 允许在选择性培养基中选择含质粒的细菌。

• 多个克隆位点 – 由多个限制性识别位点组成的短序列，用于插入外源 DNA 片段

• 插入 – 插入到质粒中的目的基因

• 启动子区域 – 转录过程中 RNA 聚合酶的结合位点

• 可选标记 – 允许选择插入基因的成功表达

• 引物结合位点 – 用作质粒 PCR 扩增以进行测序的起始位点

3. 质粒中元素的相对位置

• 质粒元件的相对位置通过限制性定位或测序进行映射。
  

4. 发起人的方向

质粒内启动子的取向对于确定质粒中所有其他元素的取向非常重要，尤其是插入基因的取向。转录在启动子的3′末端启动。因此，基因应该处于正确的方向才能表达。

结论

通过了解质粒图的特征，例如质粒的名称和大小，质粒中元素的类型及其相对位置以及启动子的方向，可以读取质粒图。