SSR批量合成记录
2023-05-12 15:07 作者:Albert_Xin | 我要投稿
SSRMMD下载:https://github.com/GouXiangJian/SSRMMD
本人最近在设计SSR引物,用于跑分子标记,然后发现很多很好用的软件都可以实现SSR的查找和引物的设计,其中TBtools是最好用之一。但是我是mac的系统,引物设计这个插件不是很好的兼容我的系统,所以在网络上查阅相关资料后发现SSRMMD这个软件能很好的将ssr查找出来并设计出引物,所以在这里记录一下。
软件的下载:
这个软件不需要特别的安转个,下载好软件就可以使用。
下面我介绍下mac下面的使用(Windows自行查看说明文档):
输入上面的内容就可以查看帮助文档
然后来个最简单的示例
就能鉴别序列中的SSR
然后用这软件下面的connetctorToPrimer3进行合成引物

-i输入的是上面SSRMMD-master的结果文件,然后就可以得到很多SSR引物,然后就拼命的跑胶吧!!!