从UCSC下载TCGA数据
尔云间一个专门做科研的团队
1. UCSC网址订制
网址：https://xenabrowser.net/
2.选择DATA SETS ，出现所有数据集。
3.选择Pan-Cancer (PANCAN) (41datasets)，得到所有信息。
4.各种数据下载(包括表达量，临床信息，突变信息等）。
TPM下载：
wget https://toil-xena-hub.s3.us-east-1.amazonaws.com/download/tcga_RSEM_gene_tpm.gz
下载phenotype
wget https://tcga-pancan-atlas-hub.s3.us-east-1.amazonaws.com/download/TCGA_phenotype_denseDataOnlyDownload.tsv.gz
下载分期
wget https://tcga-pancan-atlas-hub.s3.us-east-1.amazonaws.com/download/Survival_SupplementalTable_S1_20171025_xena_sp
下载突变信息
wget https://tcga-pancan-atlas-hub.s3.us-east-1.amazonaws.com/download/mc3.v0.2.8.PUBLIC.xena.gz
ID和Gene symbol对应列表下载
wget https://toil.xenahubs.net/download/probeMap/gencode.v23.annotation.gene.probemap
注：最终下载了所需要的各种数据类型，数据在通过服务器下载会比较快。
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