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各位小伙伴大家好，小果和大家又见面了，前面呢小果有分享果关于转录因子的一些数据库，但是都是仅仅提到了一些，今天呢小果来和大家聊一聊预测转录因子DNA结合蛋白结合识别位点的JASPAR数据库。小果下面的内容从以下方面展开：一是JASPAR数据库概况，二是简单使用JASPAR数据库。

数据库概况

JASPAR数据库是可预测转录因子结合位点，网址为：https://jaspar.genereg.net，小伙伴们点击进入之后网站首页是下面的样子。

JASPAR是一个开放获取数据库，其中包含精选的非冗余转录因子（TF）结合配置文件，存储为六个分类组中多个物种的TF的位置频率矩阵（PFM）和TF模型（TFFM）。在第9个版本中，扩展了CORE系列，增加了341个新配置文件（植物148个，脊椎动物101个，尿酸盐85个，昆虫7个），比上一个版本的扩展了19%。新版的JASPAR数据库中提供了一种新工具，用于在用户提供的基因组区域进行JASPAR TFBS浓缩分析。

数据库使用

小果在这里以查找tp53基因的转录因子为例进行简单介绍，在进入到JASPAR数据库首页，小伙伴可以发现有一个Search按钮，在搜索框输入tp53基因，点击search进行查找。

Search后得到结果页面如下，可以看到查询到的信息比较多，得到了数据ID，名称，物种，组，家族和logo，小伙伴可以选择自己想要的ID进行查看。

点击后就可以进入对应的页面，可以看到有文件概况、序列logo图、PFM矩阵（文件可下载）、和其它信息。如下所示：

至此呢，小果对于JASPAR数据库的介绍就到这里了，小伙伴们快去小试牛刀，看看自己有没有学到精髓。

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