十步测序数据上传GEO数据库

我们在阅读文献的时候，发现转录组等原始数据的都会注释GEO数据库的编号：GSExxxxxx，比如通过文献链接到：

那么我们在投稿，发表论文前，测序数据又要如何上传呢？

1，我们要首先保证在NCBI（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）有个自己的账号，新用户点击下面Sign up

2，到NCBI主界面，点击submit

3，搜索并进入GEO

3，搜索并进入GEO,点击 右上角 logn in

4， 将NCBI 账号与GEO 数据库关联并提交

5，选择自己测序类型，通过示例要求上传

6，选择以下原始数据上传的类型，测序直接得到的往往是fastq raw data

7,选择上传途径

8，可以选择FTP 上传

9，“快速连接”工具栏中输入主机（ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov），用户名（geoftp）和密码（rebUzyi1）来快速连接，会看到“快速连接”错误，可以忽略此错误。在“远程站点”地址栏中输入个性化工作区的路径（如我的路径为：/ uploads / zhaoyuhuan_8zOL842G）。然后可以通过从“本地站点”窗口拖动包含所有提交文件的文件夹并将其拖放到右侧的上传空间（“远程站点”窗口）中来传输文件。

10，待传输完成后，点击Notify GEO通知GEO审核数据，GEO官方大概在5个工作日左右回复，在收到管理员邮件确认之前不要引用GEO号。（注意根据发表情况，设置合适的公开时间）

部分参考：数据上传 | GEO数据上传操作指南 (qq.com)