CI-001：分裂者

状态： 已解散
别称： N/A
领导者： 德尔塔指挥部 (初代)
描述： 1914年6月19日，第二代O5议会中的四名成员执行了一系列策略，释放了大量收容物，其中大部分是人形生物，随后这四名O5议员叛逃，离开了基金会。一夜之间，所谓的基金会内战爆发。叛逃的O5利用其地位将部分收容物连同大批人员转移到安全地点。之后叛逃者联合袭击了基金会设施，以消灭其武装力量。该战略制定得极为完美，直至今天，分裂者对基金会造成的影响仍无法完全消除。

CI-002：混沌分裂者

状态： 活跃中
别称： N/A
领导者： 德尔塔指挥部 (第二代)
描述： 1922年2月13日，基金会启动了“神之双子”计划，并创造收容物-001（孩子们）以终结GoI-003：亚巴顿王国。德尔塔指挥部候选人文森特·阿里安斯（Vincent Arians）和亚伦·西格尔（Aaron Siegel）背叛了基金会，利用孩子们杀死了当时的管理员弗雷德里克·威廉姆斯（Frederick Williams）。之后，他们创建了新的一代——混沌分裂者。

GoI-███: 全球超自然联盟

状态: 活跃中

别称: GOC

描述: GOC是一个广泛活跃于各个领域的组织，其势力极其广泛，受到了众多国家的认可及支持。其人员包括多个领域的精英，甚至包括普罗米修斯实验室等已解散组织的成员。同时，其在异常项目方面的造诣也很深，这使得他们拥有实力强悍的武装力量和丰富的资料底蕴。但是，该组织的使命宣言：彻底毁灭超自然，使得他们走上了极端的道路，许多珍贵资料毁于一旦，大量可用异常被白白销毁。

讽刺的是，为了实现他们毁灭异常的目的，他们不得不借用超自然的力量，这使得他们的宣言显得自相矛盾。作为体量极大的组织，GOC原本可以在超自然领域获得极高的成就，但其无休止的内耗导致其始终无法处于世界进步的最前沿地位。

GoI-███: 蛇之手

状态: 活跃中

别称: N/A

描述:蛇之手是一个活跃于“被放逐者之图书馆”的小型组织，他们自诩为超自然的救主，其成员本身也有很大一部分属于异常项目。由于他们试图创建异常与人类和谐共存的社会的理念，与GOC的理念有根本性矛盾，二者经常发生冲突，甚至造成了恶性的虐杀事件。

蛇之手的宗旨与混沌分裂者有一定的相似性，这导致二者的关系一度进入蜜月期，直到蛇之手无法容忍混沌分裂者对异常项目的利用，并将其从“被放逐者”中除名。尽管如此，混沌分裂者仍应与蛇之手建立稳定的合作关系，以共同应对基金会何GOC等组织的威胁。