如何在Linux上使用源码编译安装blast

鉴于网上使用源码安装blast的文章甚少，这里提供一种编译源码安装blast的思路

准备工具：

blast最新的源码包：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/

选择适合自己系统的源码包，这里选择“ncbi-blast-2.13.0+-x64-linux.tar.gz ”

解压并进入源码路径

配置编译参数，可以使用configure --help 查看相关参数

configure的参数有以下选择，可供大家快速查看

编译时间根据电脑配置有所差别，笔者虚拟机大概编译了一个半小时

编译出的可执行文件在ncbi-blast-2.13.0+-src/c++/ReleaseMT/bin当中

为了方便在其他路径执行blast，可以将该路径加入环境变量

参考链接：

[1]    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK52640/

[2]    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK569861/#intro_Installation.Source_tarball

[3]    https://ncbi.github.io/cxx-toolkit/pages/ch_start

[4]    https://ncbi.github.io/cxx-toolkit/pages/ch_config.html#ch_config.ch_configget_synopsi

[5]    https://wap.sciencenet.cn/home.php?mod=space&do=blog&id=804622