引领4D蛋白组学新标准:更高深更灵敏更精准——鹿明生物
2022年3月9号,鹿明生物新购设备timsTOF Pro2全新上线,为更好地满足客户的需求,推动蛋白组学研究新高度,加强行业蛋白组学的研究更快、更灵敏。鹿明生物继timsTOF Pro后,继续加强蛋白组深度研究,为4D Proteomics更快、更灵敏“添砖加瓦”。
与小鹿一睹timsTOF Pro2进驻全过程吧~
随着质谱技术的飞速发展,特别是离子淌度的引入,增加了一个新的分离维度,将蛋白质组研究推进到全新的“4D蛋白质组”层面,打破了基于质谱的蛋白质组学研究的瓶颈,大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升,可以更好的解决大队列、复杂体系以及微量样本的检测。
相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配备了最新一代双TIMS分析器,离子容量可提高三倍。经过简化的离子透镜最大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,为4D-多组学建立了新的标准。CCS 值的加入让组学结果更精准,也使timsTOF Pro 2成为转化组学应用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能够实现少量细胞群或生物穿刺样本等低样本量的蛋白组定量分析以及磷酸化蛋白质组学分析,在短梯度下实现蛋白深度覆盖。
tims TOF Pro2依赖于双捕集离子淌度(TIMS)和同步累积连续碎裂(PASEF)数据采集模式两大创新技术,可实现快速采集、更高的灵敏度和特异性。同时,其配备了最新一代双 TIMS 分析器,离子容量可提高三倍,最大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,让蛋白质组学分析再上一个新的台阶,鹿明生物同时配备了Evosep One高通量色谱使其在短梯度下也能实现蛋白深度覆盖,结果更精准,也成为转化组学应用不可或缺的工具。
tims TOF Pro2特点:
1.更高扫描速度:助力临床大队列项目研究
PASEF® 驱动的timsTOF Pro 2 可以实现超过120 Hz的扫描速度,使用PASEF 可以实现对低丰度肽段离子多次重复选择并碎裂,以提高低丰度肽的二级谱图质量,从而实现了更高置信度的肽谱匹配而不会损失灵敏度和分辨率,在高通量的同时保证分析鉴定的质量。将tims TOF Pro 2 和Evosep One的强大组合应用于新冠病毒感染患者血清蛋白质组学研究,实现60样本/天(SPD)方法和PASEF 进行采集,在720 份样本中,310±18 种蛋白质被定量,其中包括70 多种潜在的生物标志物,为分析大队列研究提供了宝贵视角。
2.更高覆盖深度:助力蛋白组鉴定到更多的蛋白数量
凭借全新的TIMS 装置和新优化的dda-PASEF 方法,使用 HEK酶切样本,tims TOF Pro 2 单针上样200 ng,在60 分钟梯度下能够鉴定超过7,000种蛋白质和超过60,000条多肽,达到了前所未有的蛋白质组学覆盖深度。
3.超高灵敏度:助力微量样本蛋白组分析
随着某些特定细胞、少量细胞群或生物穿刺样本的研究需求越来越多,极微量蛋白组定量分析变得至关重要,而采用高灵敏度的质谱仪是对微量样本进行定量分析的关键。timsTOF Pro 2 上样20ng HeLa 样本,在30分钟梯度下即能够鉴定超过4,200 个蛋白和接近30,000 条多肽。
4.鉴定更可信:助力蛋白或化合物更高可信度的鉴定
利用PASEF 的速度和TIMS 对碰撞截面积(CCS)的精确测定大幅提高DIA 分析能力。dia-PASEF 比传统的DIA 方法有更高灵敏度和选择性,排除单电荷母离子降低本底噪音干扰,利用分子量和碰撞横截面 CCS 值的相关性,实现高可信度的鉴定。
5. 高灵敏度修饰肽段同分异构体分离:助力修饰蛋白组分析
dia-PASEF 在timsTOF Pro 2 上的高灵敏度、扫描速度和重现性可以实现低样本量的修饰蛋白质组学分析。例如可以实现小鼠脑样本起始总蛋白量仅为25μg的磷酸化蛋白质组的非标记定量分析,使用Evosep的30 样本/天的分析方法,三次重复可鉴定出多达4473个特有的磷酸化多肽。
采用PASEF 技术能够鉴定27,768 个磷酸化肽,展现了淌度辅助质量对齐(MOMA) 的优势。1946 条鉴定的共洗脱异构体中,20% 的异构体可以被TIMS完全分离,这使得我们可以更好地理解蛋白磷酸化准确位点信息。

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鹿明生物tims TOF Pro服务及应用产品:
上海鹿明生物科技有限公司多年来,一直专注于生命科学和生命技术领域,是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析的团队。经过多年的发展沉淀,公司建立起了4D-DIA/LFQ/PRM、iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修饰蛋白组等蛋白组学技术平台。
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