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基因编辑方案设计真的靠谱吗?源井生物来告诉你!

2021-06-09 18:36 作者:源井生物  | 我要投稿


众所周知,CRISPR/Cas技术相较于其他编辑手段有很大的优势,但是在实际应用CRISPR/Cas技术进行基因敲除时,难免会遇到许多问题,毕竟CRISPR/Cas技术从被发现到被使用也不过寥寥数年,实验经验较为不足,这不仅导致实验试错成本增加,甚至会影响科研人员的积极性。

而减少试错成本最重要的手段就是预先设计实验方案并进行预实验,但是一个好的实验方案真的这么容易设计吗?仅仅gRNA的序列设计这一步就要考虑各种问题,包括如何才能覆盖更多的转录本,如何尽量避免截短蛋白的表达,要同时使用几个gRNA等等,甚至基因测序结果已经明确地表明已经完全敲除了,但WB的结果却让人仿佛在看一场世纪灵异事件大赏……

因此一个便捷又智能的CRISPR基因编辑方案设计工具就十分重要了,但且不说这个方案设计系统是否使用便捷,最基本的是,我们要如何确保这个系统设计出来的方案可行性足够高呢?

目前国内只有一个由源井生物自主研发的免费CRISPR基因编辑系统——红棉CRISPR基因编辑系统,那么就来看看源井生物的专家团队是如何解决这个问题的?

除了结合了两大数据库(Ensemble、NCBI数据库)的庞大数据,他们还加入了5000例基因成功敲除的独家真实数据,并进一步结合生物信息技术对这些大数据进行多维度的全方面分析,综合计算了所有转录本、外显子、编码区的位置、大小等参数,最终综合得出最佳gRNA敲除区域,当然方案中还有更多能供你评估敲除风险的参数。

除了保证红棉系统所设计的方案的可行性,源井生物的专业团队也在不断优化-红棉系统的使用感,目前红棉系统可智能设计涵盖10大研究物种的基因敲除方案,只需输入基因名/基因ID就可得到3套优质的gRNA基因敲除方案,包括移码敲除、小片段敲除或大片段敲除,能基本满足你的研究需求,并且没有复杂的注册流程,只需扫码关注公众号即可使用,后续也可通过扫描二维码进行登录使用,进一步节约你的宝贵时间。

当然,从红棉系统上线至今,也有许多科研工作者对红棉系统以及背后的源井生物团队表示认可或者提出宝贵建议,在未来源井生物也会秉持着最初的目标不断前行,让更多对CRISPR/Cas9技术感兴趣的科研工作者们在使用CRISPR/Cas9技术时能更多地感受到这个被誉为“基因剪刀”的基因编辑工具的魅力,而不是被信息滞后等多种因素影响对科研的热情。


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